The extended spectrum of RAS‐MAPK pathway mutations in colorectal cancer

生物 结直肠癌 MAPK/ERK通路 癌症研究 遗传学 光谱(功能分析) 突变 癌症 计算生物学 信号转导 基因 物理 量子力学
作者
Danielle C. Costigan,Fei Dong
出处
期刊:Genes, Chromosomes and Cancer [Wiley]
卷期号:59 (3): 152-159 被引量:14
标识
DOI:10.1002/gcc.22813
摘要

Current clinical guidelines recommend mutation analysis for select codons in KRAS and NRAS exons 2, 3, and 4 and BRAF V600E to guide therapy selection and prognostic stratification in advanced colorectal cancer. This study evaluates the impact of extended molecular testing on the detection of RAS-MAPK pathway mutations. Panel next-generation sequencing results of colorectal cancer specimens from 5795 individuals from the American Association for Cancer Research Project Genomics Evidence Neoplasia Information Exchange (AACR Project GENIE) were included. Mutations in RAS-MAPK pathway genes were analyzed and functionally annotated. Colorectal cancers had recurrent pathogenic pathway activating mutations in KRAS (44%), NRAS (4%), HRAS (<1%), BRAF (10%), MAP2K1 (1%), RAF1 (<1%), and PTPN11 (<1%). The proportion of colorectal cancers with pathogenic RAS pathway mutations was 37% when only KRAS codon 12 and 13 mutations were considered, 46% when also including select KRAS and NRAS exons 2, 3, and 4 mutations, 53% when including BRAF V600E mutations, and 56% when including all pathogenic mutations. Panel next-generation sequencing testing identifies additional RAS-MAPK pathway driver mutations beyond current guideline recommendations. These mutations have potential implications in treatment selection for patients with advanced colorectal cancer.

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