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Intrinsic mechanisms for the inhibition effect of graphene oxide on the catalysis activity of alpha amylase

化学 色氨酸 淀粉酶 氢键 范德瓦尔斯力 猝灭(荧光) 氧化物 石墨烯 蛋白质结构 生物化学 立体化学 生物物理学 荧光 氨基酸 有机化学 分子 纳米技术 生物 材料科学 物理 量子力学
作者
Xinwei Liu,Binbin Sun,Chunyi Xu,Tianxu Zhang,Yinqing Zhang,Lingyan Zhu
出处
期刊:Journal of Hazardous Materials [Elsevier BV]
卷期号:453: 131389-131389 被引量:13
标识
DOI:10.1016/j.jhazmat.2023.131389
摘要

Comprehending the interactions between graphene oxide (GO) and enzymes is critical for understanding the toxicities of GO. In this study, the inherent interactions of GO with α-amylase as a typical enzyme, and the impacts of GO on the conformation and biological activities of α-amylase were systematically investigated. The results reveal that GO formed ground-state complex with α-amylase primarily via hydrogen bonding and van der Waals interactions, thus quenching the intrinsic fluorescence of the protein statically. Particularly, the strong interactions altered the microenvironment of tyrosine and tryptophan residues, caused rearrangement of polypeptide structure, and reduced the contents of α-helices and β-sheets, thus changing the conformational structure of α-amylase. According to molecular docking results, GO binds with the amino acid residues (i.e., His299, Asp300, and His305) of α-amylase mainly through hydrogen bonding, which is in accordance with in vitro incubation experiments. As a consequence, the ability of α-amylase to catalyze starch hydrolysis into glucose was depressed by GO, suggesting that GO might cause dysfunction of α-amylase. This study discloses the intrinsic binding mechanisms of GO with α-amylase and provides novel insights into the adverse effects of GO as it enters organisms.
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