OSeac: An Online Survival Analysis Tool for Esophageal Adenocarcinoma

食管腺癌 腺癌 生存分析 医学 肿瘤科 对数秩检验 内科学 基因表达谱 食管癌 危险系数 生物信息学 基因 生物 基因表达 癌症 置信区间 遗传学
作者
Qiang Wang,Zhongyi Yan,Linna Ge,Ning Li,Mengsi Yang,Xiaoxiao Sun,Longxiang Xie,Guosen Zhang,Wan Zhu,Yunlong Wang,Yongqiang Li,Xianzhe Li,Xiangqian Guo
出处
期刊:Frontiers in Oncology [Frontiers Media SA]
卷期号:10 被引量:8
标识
DOI:10.3389/fonc.2020.00315
摘要

Esophageal Adenocarcinoma (EAC) is one of the most common gastrointestinal tumors in the world. However, molecular prognostic systems are still lacking for EAC. Hence, we developed an Online consensus Survival analysis web server for Esophageal Adenocarcinoma (OSeac), to centralize published gene expression data and clinical follow up data of EAC patients from The Cancer Genome Atlas (TCGA) and Gene Expression Omnibus (GEO). OSeac includes 198 EAC cases with gene expression profiling and relevant clinical long-term follow-up data, and employs the Kaplan Meier (KM) survival plot with hazard ratio (HR) and log rank test to estimate the prognostic potency of genes of interests for EAC patients. Moreover, we have determined the reliability of OSeac by using previously reported prognostic biomarkers such as DKK3, CTO1, and TXNIP. OSeac is free and publicly accessible at http://bioinfo.henu.edu.cn/EAC/EACList.jsp.
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