Ligand binding by butadiyne-linked porphyrin dimers, trimers and tetramers

三聚体 四聚体 化学 二聚体 卟啉 结合常数 配体(生物化学) 合作约束 立体化学 结晶学 光化学 结合位点 受体 有机化学 生物化学
作者
Harry L. Anderson,S. Anderson,Jeremy K. M. Sanders
出处
期刊:Journal of the Chemical Society 卷期号: (18): 2231-2231 被引量:140
标识
DOI:10.1039/p19950002231
摘要

The binding of oligopyridyl ligands to butadiyne-linked zinc porphyrin dimers, trimers and tetramers has been investigated in detail using NMR and electronic spectroscopy. Pyridine binds to zinc porphyrin monomers in CH2Cl2 solution at 300 K with binding constants of ca. 103 mol–1 dm3, while 4,4′-bipyridyl binds to the cyclic zinc porphyrin dimer with a binding constant of 1 × 109 mol–1 dm3, giving an effective molarity, or chelation factor, of 76 mol dm–3. The analogous linear dimer binds to this ligand 100 times less strongly, but adopts a similar conformation when bound. s-Tri(4-pyridyl)triazine has an affinity of ca. 1010 mol–1 dm3 for the cyclic zinc trimer, reflecting reasonably good host–guest complementarity. The affinity of 4,4′-bipyridyl for the trimer is ca. 105 mol–1 dm3, implying two-point binding accompanied by host distortion and strain which reduce the binding constant; the trimer is therefore an elastic host, able to respond to the geometrical demands of rigid guests. The cyclic tetramer is a relatively flexible molecule, but its complexes with both bidentate and tetradentate ligands have more highly defined geometries. The cyclic dimer and trimer have open pre-organised cavities, with no conformational barrier to ligand binding inside the cavity, whereas the cyclic tetramer can adopt many conformations in free solution.
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