Identification of the HLA-DM/HLA-DR interface

主要组织相容性复合体 人类白细胞抗原 MHC I级 抗原呈递 MHC II级 对接(动物) 抗原处理 化学 川东北74 MHC限制 计算生物学 抗原 生物 遗传学 生物化学 免疫系统 T细胞 医学 护理部
作者
Matthew Davies,Abigail Lamikanra,Clare Sansom,Darren R. Flower,D. S. Moss,Paul Travers
出处
期刊:Molecular Immunology [Elsevier BV]
卷期号:45 (4): 1063-1070 被引量:9
标识
DOI:10.1016/j.molimm.2007.07.033
摘要

Human leukocyte antigen (HLA)-DM is a critical participant in antigen presentation that catalyzes the dissociation of the Class II-associated Invariant chain-derived Peptide (CLIP) from the major histocompatibility complex (MHC) Class II molecules. There is competition amongst peptides for access to an MHC Class II groove and it has been hypothesised that DM functions as a ‘peptide editor’ that catalyzes the replacement of one peptide for another within the groove. It is established that the DM catalyst interacts directly with the MHC Class II but the precise location of the interface is unknown. Here, we combine previously described mutational data with molecular docking and energy minimisation simulations to identify a putative interaction site of >4000 Å2 which agrees with known point mutational data for both the DR and DM molecule. The docked structure is validated by comparison with experimental data and previously determined properties of protein–protein interfaces. A possible dissociation mechanism is suggested by the presence of an acidic cluster near the N terminus of the bound peptide.
最长约 10秒,即可获得该文献文件

科研通智能强力驱动
Strongly Powered by AbleSci AI
更新
PDF的下载单位、IP信息已删除 (2025-6-4)

科研通是完全免费的文献互助平台,具备全网最快的应助速度,最高的求助完成率。 对每一个文献求助,科研通都将尽心尽力,给求助人一个满意的交代。
实时播报
充电宝应助草影花飘采纳,获得10
刚刚
徐凤梨完成签到,获得积分10
1秒前
柯续缘完成签到,获得积分10
1秒前
欢呼妙菱完成签到,获得积分10
2秒前
小二郎应助柒柒采纳,获得10
2秒前
隐形的傲易完成签到 ,获得积分10
3秒前
机智毛豆完成签到,获得积分10
3秒前
结实星星发布了新的文献求助10
3秒前
酷波er应助Jiang采纳,获得10
3秒前
3秒前
彬子完成签到,获得积分10
3秒前
aaa0001984完成签到,获得积分0
4秒前
4秒前
5秒前
科研通AI5应助龙抬头采纳,获得10
5秒前
善学以致用应助lzh采纳,获得10
5秒前
小生怕怕完成签到,获得积分10
5秒前
科研通AI2S应助huyang采纳,获得10
5秒前
felix发布了新的文献求助10
6秒前
6秒前
香蕉觅云应助踏月偷心采纳,获得10
6秒前
6秒前
biog12完成签到,获得积分10
7秒前
7秒前
大海完成签到,获得积分10
7秒前
7秒前
白给的吉发布了新的文献求助10
8秒前
所所应助蔬菜狗狗采纳,获得10
8秒前
XT666完成签到,获得积分10
8秒前
zhuyy完成签到,获得积分10
8秒前
呀呀呀呀完成签到,获得积分10
8秒前
9秒前
小蘑菇应助nqterysc采纳,获得10
9秒前
9秒前
JIE发布了新的文献求助10
9秒前
x_x完成签到,获得积分10
9秒前
zhuzhu完成签到,获得积分10
9秒前
10秒前
嘻嘻印完成签到,获得积分10
10秒前
专一的凝荷完成签到,获得积分10
10秒前
高分求助中
A new approach to the extrapolation of accelerated life test data 1000
Cognitive Neuroscience: The Biology of the Mind 1000
Technical Brochure TB 814: LPIT applications in HV gas insulated switchgear 1000
Immigrant Incorporation in East Asian Democracies 600
Nucleophilic substitution in azasydnone-modified dinitroanisoles 500
不知道标题是什么 500
A Preliminary Study on Correlation Between Independent Components of Facial Thermal Images and Subjective Assessment of Chronic Stress 500
热门求助领域 (近24小时)
化学 材料科学 医学 生物 工程类 有机化学 生物化学 物理 内科学 纳米技术 计算机科学 化学工程 复合材料 遗传学 基因 物理化学 催化作用 冶金 细胞生物学 免疫学
热门帖子
关注 科研通微信公众号,转发送积分 3968719
求助须知:如何正确求助?哪些是违规求助? 3513608
关于积分的说明 11168681
捐赠科研通 3248960
什么是DOI,文献DOI怎么找? 1794573
邀请新用户注册赠送积分活动 875194
科研通“疑难数据库(出版商)”最低求助积分说明 804716