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Rapid and Accurate Assembly of Large DNA Assisted by In Vitro Packaging of Bacteriophage

噬菌体 核酸外切酶 合成生物学 体外重组 DNA 质粒 计算生物学 生物 分子生物学 计算机科学 遗传学 DNA聚合酶 分子克隆 基因 大肠杆菌 基因表达
作者
Sukekatsu Nozaki
出处
期刊:ACS Synthetic Biology [American Chemical Society]
卷期号:11 (12): 4113-4122 被引量:6
标识
DOI:10.1021/acssynbio.2c00419
摘要

Development of DNA assembly methods made it possible to construct large DNA. However, achieving a large DNA assembly easily, accurately, and at a low cost remains a challenge. This study shows that DNA assembled only by annealing of overlapping single-stranded DNA ends, which are generated by exonuclease treatment, without ligation can be packaged in phage particles and can also be transduced into bacterial cells. Based on this, I developed a simple method to construct long DNA of about 40-50 kb from five to ten PCR fragments using the bacteriophage in vitro packaging system. This method, namely, iPac (in vitroPackaging-assisted DNA assembly), allowed accurate and rapid construction of large plasmids and phage genomes. This simple method will accelerate research in molecular and synthetic biology, including the construction of gene circuits or the engineering of metabolic pathways.
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