Chalcones reloaded: an integration of network pharmacology and molecular docking for type 2 diabetes therapy

蛋白质数据库 对接(动物) 化学 生物信息学 虚拟筛选 计算生物学 结合亲和力 药理学 活动站点 氢键 立体化学 组合化学 生物化学 药效团 受体 医学 生物 分子 基因 护理部 有机化学
作者
Sarvesh Sabarathinam,Nila Ganamurali
出处
期刊:Journal of Biomolecular Structure & Dynamics [Informa]
卷期号:: 1-13 被引量:7
标识
DOI:10.1080/07391102.2023.2252085
摘要

Chalcones have various biological effects, from immune boosting to anti-cancer and anti-diabetic. Structurally modified chalcones (SMC) are clinically relevant for diabetes and cardiometabolic complications. From the original research articles, a structurally proven and biologically outstanding 14 structurally modified chalcones were screened and inducted in this study. This study evaluated the effects of SMC towards diabetes via network pharmacology analysis. The network data shows compounds S2, S3, S5, S9 &S12 suit the diabetes target. Especially Compounds S5 and S9 have a higher binding affinity towards the targets of TNF, PI3K, MAPK1 and AKT1 active sites. Compound S9 [(E)-3-(4-(1H-imidazol-1-yl)phenyl)-1-(4-(2,4-difluorobenz-yloxy)phenyl)prop-2-en-1-one] have identified with stronger binding affinities towards the active sites of MAPK3 (PDB:4QTB) -10.5(Kcal/mol). To provide a more effective mechanism for demonstrating protein-ligand interaction, one of the molecular docking complex (ERK2 kinase-S5) was subjected to a molecular dynamic at 300K for 100 ns. In term of structural stability, structure compactness, residual flexibility and hydrogen bond interaction of the complex was evaluated Integrating network pharmacology, in silico virtual screening, and molecular docking analysis shows that structurally modified compounds are effective and may help identify lead compounds towards glycemic control.Communicated by Ramaswamy H. Sarma.
最长约 10秒,即可获得该文献文件

科研通智能强力驱动
Strongly Powered by AbleSci AI
科研通是完全免费的文献互助平台,具备全网最快的应助速度,最高的求助完成率。 对每一个文献求助,科研通都将尽心尽力,给求助人一个满意的交代。
实时播报
刚刚
bkagyin应助幽默钢笔采纳,获得10
2秒前
2秒前
7秒前
terence完成签到,获得积分10
8秒前
在水一方应助带帽采纳,获得10
8秒前
8秒前
9秒前
lailai完成签到 ,获得积分10
10秒前
科研通AI5应助诚心的平松采纳,获得10
12秒前
James发布了新的文献求助10
14秒前
研友_LBKOgn完成签到,获得积分20
15秒前
Ava应助CartGo采纳,获得10
17秒前
俏皮的采波完成签到,获得积分10
17秒前
JamesPei应助吕妍采纳,获得30
20秒前
aaa完成签到 ,获得积分10
22秒前
21发布了新的文献求助10
22秒前
冷傲迎梦完成签到,获得积分20
23秒前
不倦应助1234采纳,获得10
25秒前
阿南完成签到 ,获得积分10
27秒前
zhong完成签到,获得积分10
28秒前
30秒前
kxy完成签到,获得积分10
32秒前
美好的思松完成签到,获得积分10
33秒前
34秒前
土豆完成签到,获得积分10
34秒前
科研通AI5应助真凉大魔王采纳,获得10
36秒前
生动听筠发布了新的文献求助30
36秒前
陈瑶完成签到,获得积分10
37秒前
xiaolu发布了新的文献求助10
39秒前
赶紧毕业发布了新的文献求助10
40秒前
41秒前
迷人世开完成签到,获得积分10
41秒前
大模型应助科研通管家采纳,获得10
42秒前
深情安青应助科研通管家采纳,获得10
42秒前
共享精神应助科研通管家采纳,获得10
42秒前
Singularity应助科研通管家采纳,获得20
42秒前
2345应助科研通管家采纳,获得10
42秒前
脑洞疼应助科研通管家采纳,获得10
42秒前
科研通AI5应助科研通管家采纳,获得10
42秒前
高分求助中
Continuum Thermodynamics and Material Modelling 3000
Production Logging: Theoretical and Interpretive Elements 2700
Les Mantodea de Guyane Insecta, Polyneoptera 1000
Structural Load Modelling and Combination for Performance and Safety Evaluation 1000
Conference Record, IAS Annual Meeting 1977 820
England and the Discovery of America, 1481-1620 600
電気学会論文誌D(産業応用部門誌), 141 巻, 11 号 510
热门求助领域 (近24小时)
化学 材料科学 生物 医学 工程类 有机化学 生物化学 物理 纳米技术 计算机科学 内科学 化学工程 复合材料 基因 遗传学 物理化学 催化作用 量子力学 光电子学 冶金
热门帖子
关注 科研通微信公众号,转发送积分 3572635
求助须知:如何正确求助?哪些是违规求助? 3142841
关于积分的说明 9449037
捐赠科研通 2844177
什么是DOI,文献DOI怎么找? 1563386
邀请新用户注册赠送积分活动 731723
科研通“疑难数据库(出版商)”最低求助积分说明 718679