清晨好,您是今天最早来到科研通的研友!由于当前在线用户较少,发布求助请尽量完整地填写文献信息,科研通机器人24小时在线,伴您科研之路漫漫前行!

Integrated Analysis of Colorectal Cancer Reveals Cross-Cohort Gut Microbial Signatures and Associated Serum Metabolites

代谢组 结直肠癌 肠道菌群 代谢组学 队列 微生物群 基因组 代谢物 生物 医学 内科学 癌症 肿瘤科 生理学 生物信息学 遗传学 免疫学 基因
作者
Renyuan Gao,Chunyan Wu,Yefei Zhu,Cheng Kong,Yin Zhu,Yaohui Gao,Xiaohui Zhang,Rong Yang,Hui Zhong,Xiao Xiong,Chunqiu Chen,Qian Xu,Huanlong Qin
出处
期刊:Gastroenterology [Elsevier BV]
卷期号:163 (4): 1024-1037.e9 被引量:68
标识
DOI:10.1053/j.gastro.2022.06.069
摘要

Studies have reported abnormal gut microbiota or circulating metabolome associated with colorectal cancer (CRC), but it remains a challenge to capture the CRC-relevant features consistent across geographic regions. This is particularly the problem for metabolic traits of CRC because the analyses generally use different platforms and laboratory methods, which poses a barrier to cross-dataset examination. In light of this, we sought to elucidate the microbial and metabolic signatures of CRC with broad population relevance.In this integrated metagenomic (healthy controls [HC], n = 91; colorectal adenoma [CRA], n = 63; CRC, n = 71) and metabolomic (HC, n = 34; CRA, n = 31; CRC, n = 35) analysis, CRC-associated features and microbe-metabolite correlations were first identified from a Shanghai cohort. A gut microbial panel was trained in the in-house cohort and cross-validated in 7 published metagenomic datasets of CRC. The in-house metabolic connections to the cross-cohort microbial signatures were used as evidence to infer serum metabolites with potentially external relevance. In addition, a combined microbe-metabolite panel was produced for diagnosing CRC or adenoma.CRC-associated alterations were identified in the gut microbiome and serum metabolome. A composite microbe-metabolite diagnostic panel was developed and yielded an area under the curve of 0.912 for adenoma and 0.994 for CRC. We showed that many CRC-associated metabolites were linked to cross-cohort gut microbiome signatures of the disease, including CRC-enriched leucylalanine, serotonin, and imidazole propionate; and CRC-depleted perfluorooctane sulfonate, 2-linoleoylglycerol (18:2), and sphingadienine.We generated cross-cohort metagenomic signatures of CRC, some of which linked to in-house CRC-associated serum metabolites. The microbial and metabolic shifts may have wide population relevance.
最长约 10秒,即可获得该文献文件

科研通智能强力驱动
Strongly Powered by AbleSci AI
更新
PDF的下载单位、IP信息已删除 (2025-6-4)

科研通是完全免费的文献互助平台,具备全网最快的应助速度,最高的求助完成率。 对每一个文献求助,科研通都将尽心尽力,给求助人一个满意的交代。
实时播报
忒寒碜完成签到,获得积分10
10秒前
橙子完成签到 ,获得积分10
11秒前
追梦发布了新的文献求助10
17秒前
英俊的铭应助笨笨的寄真采纳,获得10
25秒前
顺利毕业完成签到 ,获得积分10
27秒前
默默完成签到 ,获得积分10
32秒前
35秒前
tyro完成签到,获得积分10
44秒前
husky完成签到,获得积分10
44秒前
zzhui完成签到,获得积分10
1分钟前
徐伟康完成签到 ,获得积分10
1分钟前
Aswl完成签到 ,获得积分10
1分钟前
1分钟前
冷傲凝琴完成签到,获得积分10
1分钟前
LEE123完成签到,获得积分10
1分钟前
ceeray23发布了新的文献求助50
1分钟前
ming123ah完成签到,获得积分10
1分钟前
西瓜完成签到 ,获得积分10
1分钟前
完美世界应助科研通管家采纳,获得10
1分钟前
科研通AI2S应助科研通管家采纳,获得10
1分钟前
小小完成签到,获得积分10
1分钟前
大力的紊发布了新的文献求助50
1分钟前
2分钟前
ceeray23发布了新的文献求助20
2分钟前
CHEN完成签到 ,获得积分10
2分钟前
LJ_2完成签到 ,获得积分10
2分钟前
dingding发布了新的文献求助10
2分钟前
2分钟前
laber完成签到,获得积分0
2分钟前
zxx完成签到 ,获得积分10
2分钟前
开心完成签到 ,获得积分10
2分钟前
虞无声完成签到,获得积分10
2分钟前
3分钟前
harden9159完成签到,获得积分10
3分钟前
wbh发布了新的文献求助10
3分钟前
追梦完成签到,获得积分10
3分钟前
万能图书馆应助wbh采纳,获得10
3分钟前
如意的馒头完成签到 ,获得积分10
3分钟前
大力的紊完成签到,获得积分10
3分钟前
完美世界应助科研通管家采纳,获得10
3分钟前
高分求助中
The Mother of All Tableaux: Order, Equivalence, and Geometry in the Large-scale Structure of Optimality Theory 3000
A new approach to the extrapolation of accelerated life test data 1000
ACSM’s Guidelines for Exercise Testing and Prescription, 12th edition 500
Indomethacinのヒトにおける経皮吸収 400
Phylogenetic study of the order Polydesmida (Myriapoda: Diplopoda) 370
基于可调谐半导体激光吸收光谱技术泄漏气体检测系统的研究 350
Robot-supported joining of reinforcement textiles with one-sided sewing heads 320
热门求助领域 (近24小时)
化学 材料科学 医学 生物 工程类 有机化学 生物化学 物理 内科学 纳米技术 计算机科学 化学工程 复合材料 遗传学 基因 物理化学 催化作用 冶金 细胞生物学 免疫学
热门帖子
关注 科研通微信公众号,转发送积分 3990809
求助须知:如何正确求助?哪些是违规求助? 3532233
关于积分的说明 11256603
捐赠科研通 3271081
什么是DOI,文献DOI怎么找? 1805229
邀请新用户注册赠送积分活动 882302
科研通“疑难数据库(出版商)”最低求助积分说明 809236