Multiomics analyses and machine learning of nuclear receptor coactivator 6 reveal its essential role in hepatocellular carcinoma

肝细胞癌 癌症研究 肝硬化 核受体 基因敲除 小RNA 辅活化剂 免疫系统 肝癌 医学 生物 癌症 生物信息学 免疫学 转录因子 内科学 细胞凋亡 基因 生物化学
作者
Yirong Fang,Yuyan Xu,Wei Liao,Tao Ji,Linyuan Yu,Longhai Li,Mingxin Pan,Dinghua Yang
出处
期刊:Cancer Science [Wiley]
卷期号:114 (1): 75-90 被引量:2
标识
DOI:10.1111/cas.15577
摘要

Nuclear receptor coactivator 6 (NCOA6), a coactivator of numerous nuclear receptors and transcription factors, regulates multiple critical cellular functions. Nuclear receptor coactivator 6 is dysregulated in various cancers, including hepatocellular carcinoma (HCC); however, its role remains largely unknown. Here we reported that NCOA6 was highly expressed in HCC compared to the adjacent liver tissue, and NCOA6 overexpression was significantly correlated with poor HCC prognosis. Experiments revealed that the knockdown of NCOA6 damaged the proliferation, migration, and invasion of HCC cells. Multiomics and immune infiltration analyses showed a close relationship between NCOA6 expression, multiple cancer-related malignant pathways, and the immunosuppressive microenvironment. Finally, we established an effective NCOA6-related microRNA (miRNA) signature to distinguish HCC from hepatitis\liver cirrhosis patients. To the best of our knowledge, this study is the first to provide a comprehensive analysis of NCOA6 expression in HCC. We found that NCOA6 plays an important role in HCC development and has a potential mechanism of action. Establishing an NCOA6-related miRNA signature will help develop novel diagnostic strategies for HCC patients.

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