Identification and validation of an H2AZ1-based index model: a novel prognostic tool for hepatocellular carcinoma

肝细胞癌 基因敲除 比例危险模型 癌症研究 医学 肿瘤科 基因 内科学 生物信息学 生物 遗传学
作者
Jiamin Gao,Qinchen Lu,Jialing Zhong,Li Z,Lixin Pan,Chao Feng,Shaomei Tang,Qingji Wang,Yuting Tao,Xiaoting Zhou,Qiuyan Wang
出处
期刊:Aging [Impact Journals, LLC]
标识
DOI:10.18632/aging.205497
摘要

The H2A.Z variant histone 1 (H2AZ1) is aberrantly expressed in various tumors, correlating with an unfavorable prognosis. However, its role in hepatocellular carcinoma (HCC) remains unclear. We aimed to elucidate the pathways affected by H2AZ1 and identify promising therapeutic targets for HCC. Following bioinformatic analysis of gene expression and clinical data from The Cancer Genome Atlas and Gene Expression Omnibus database, we found 6,344 dysregulated genes related to H2AZ1 overexpression in HCC tissues (P < 0.05). We performed weighted gene co-expression network analysis to identify the gene module most related to H2AZ1. The H2AZ1-based index was further developed using Cox regression analysis, which revealed that the poor prognosis in the high H2AZ1-based index group could be attributed to elevated tumor stemness (P < 0.05). Moreover, the clinical model showed good prognostic potential (AUC > 0.7). We found that H2AZ1 knockdown led to reduced superoxide dismutase (SOD) activity, elevated malondialdehyde (MDA) levels, and increased apoptosis rate in tumor cells (P < 0.001). Thus, we developed an H2AZ1-based index model with the potential to predict the prognosis of patients with HCC. Our findings provide initial evidence that H2AZ1 overexpression plays a pivotal role in HCC initiation and progression.

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