Expanding the terpene biosynthetic code with non-canonical 16 carbon atom building blocks

萜烯 代谢工程 模块化设计 化学空间 合成生物学 萜类 化学 计算生物学 生物 计算机科学 药物发现 有机化学 生物化学 程序设计语言
作者
Codruta Ignea,Morten H. Raadam,Aikaterini Koutsaviti,Yong Zhao,Yao-Tao Duan,Maria Harizani,Karel Miettinen,Panagiota Georgantea,Mads Rosenfeldt,Sara E. Viejo-Ledesma,Mikael Agerlin Petersen,Wender L.P. Bredie,Dan Staerk,Vassilios Roussis,Efstathia Ioannou,Sotirios C. Kampranis
出处
期刊:Nature Communications [Nature Portfolio]
卷期号:13 (1) 被引量:18
标识
DOI:10.1038/s41467-022-32921-w
摘要

Humankind relies on specialized metabolites for medicines, flavors, fragrances, and numerous other valuable biomaterials. However, the chemical space occupied by specialized metabolites, and, thus, their application potential, is limited because their biosynthesis is based on only a handful of building blocks. Engineering organisms to synthesize alternative building blocks will bypass this limitation and enable the sustainable production of molecules with non-canonical chemical structures, expanding the possible applications. Herein, we focus on isoprenoids and combine synthetic biology with protein engineering to construct yeast cells that synthesize 10 non-canonical isoprenoid building blocks with 16 carbon atoms. We identify suitable terpene synthases to convert these building blocks into C16 scaffolds and a cytochrome P450 to decorate the terpene scaffolds and produce different oxygenated compounds. Thus, we reconstruct the modular structure of terpene biosynthesis on 16-carbon backbones, synthesizing 28 different non-canonical terpenes, some of which have interesting odorant properties.

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