Bis-enzyme cascade CRISPR-Cas12a platform for miRNA detection

反式激活crRNA 清脆的 化学 小RNA 核糖核酸 聚合酶 计算生物学 DNA T7 RNA聚合酶 分子生物学 多路复用 核酸 生物传感器 Cas9 生物化学 基因 生物 遗传学 大肠杆菌 噬菌体
作者
Zixuan Guo,Xiao Tan,Haoyu Yuan,Ling Zhang,Jiajia Wu,Zhiqing Yang,Ke Qu,Yi Wan
出处
期刊:Talanta [Elsevier]
卷期号:252: 123837-123837 被引量:16
标识
DOI:10.1016/j.talanta.2022.123837
摘要

MicroRNA (miRNA) play a vital role in the pathological development of many diseases. It is considered to be the diagnosis and potential biomarkers of prognosis. Herein, we proposed Bis-enzyme cascade Platform by combining T7 RNA polymerase and CRISPR-Cas12a (BPTC) for a miRNA detection. In the proposed BPTC, the RNA to DNA conversion ability of phi29 amplification and trans-cleavage of CRISPR-Cas12a are combined. The target miRNA can be amplified after binding to the recognizer ssDNA, and then transcribed the CRISPR-derived RNA (crRNA) by T7 RNA polymerase. The produced crRNA can thereby be assembled by CRISPR-Cas12a and recognized with its target dsDNA, thus triggered its trans-cleavage towards surrounding fluorescent reporters, labeled with a fluorophore and a corresponding quenching group. Based on the bis-enzyme cascade system, the biosensor shows highly sensitivity and excellent specificity. Moreover, this study provided a novel all-in-one detect strategy for miRNA and may open a new idea for the design of CRISR-Cas-based miRNA biosensing platforms.
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