Constructions and Properties of Efficient DNA Synthesis Codes

争先恐后 编码(社会科学) DNA 冗余(工程) 计算机科学 DNA合成 算法 并行计算 计算生物学 理论计算机科学 生物 数学 遗传学 统计 操作系统
作者
Kees A. Schouhamer Immink,Kui Cai,Tuan Thanh Nguyen,Jos H. Weber
出处
期刊:IEEE Transactions on Molecular, Biological, and Multi-Scale Communications [Institute of Electrical and Electronics Engineers]
卷期号:10 (2): 289-296
标识
DOI:10.1109/tmbmc.2024.3401583
摘要

We report on coding methods for efficiently synthesizing deoxyribonucleic acid (DNA) for massive data storage, where a plurality of DNA strands are synthesized in parallel. We examine the trade-offs between the information contents, redundancy, and the average or maximum number of cycles required for synthesizing a plurality of parallel DNA strands. We analyze coding methods such as guided scrambling and constrained codes for minimizing the cycle count.
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