Nrf2-regulated antioxidant response ameliorating ionizing radiation-induced damages explored throughin vitroand molecular dynamics simulations

化学 氧化应激 抗氧化剂 电离辐射 生物物理学 KEAP1型 DNA损伤 生物信息学 活性氧 分子动力学 体内 生物化学 药理学 辐照 生物 DNA 转录因子 计算化学 基因 遗传学 物理 核物理学
作者
Tamizh Selvan Gnanasekaran,Avinash Karkada Ashok,S.J. Aditya Rao,Pavan Gollapalli,R Vishakh,N. Suchetha Kumari,Nabo Kumar Chaudhury
出处
期刊:Journal of Biomolecular Structure & Dynamics [Taylor & Francis]
卷期号:41 (17): 8472-8484 被引量:6
标识
DOI:10.1080/07391102.2022.2137245
摘要

This study aims to investigate the mechanism of natural antioxidant ferulic acid (FA) in reducing oxidative stress followed by its inhibitory effect on the Keap1-Nrf2 complex. FA was treated ex vivo with human blood for 30 min at 37 °C ± 1 °C and exposed to 1.5 Gy of γ- rays of 60Co (0.789 Gy/min) and allowed for repair for an hour at 37 °C ± 1 °C. FA's free radical scavenging capacity was measured using 2,7-dichlorofluorescein diacetate assay and cytogenetic assays. Further, a possible mechanism of protein-ligand interaction between FA and Keap1-Nrf2 pathway protein as a cellular drug target was studied using docking and molecular dynamics simulation. The 1.5 Gy of γ- rays exposed to pre-treated blood with FA showed a significant (p < 0.05) reduction in reactive oxygen species and DNA damage compared to the normal control blood group sample. The ligand-protein transient binding interaction in molecular dynamic simulation over a period of 100 ns was consistent and stable emphasizing complementary charge between the protein and ligand, speculating higher hydrophobic amino acid residues in the Keap1 active pocket. This might sway the Keap1 from interaction with Nrf2, and could lead to nuclear translocation of Nrf2 during radiation-induced oxidative stress. The present study emphasizes the radioprotective effect of FA against 1.5 Gy of γ- rays exposed to human blood and the application of in silico approaches helpful for the possible protective effect of FA.Communicated by Ramaswamy H. Sarma
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