Cellular Ligand–Receptor Perturbations Unravel MEIS2 as a Key Factor for the Aggressive Progression and Prognosis in Stage II/III Colorectal Cancer

相互作用体 结直肠癌 肿瘤科 阶段(地层学) 癌症 亚型 生物信息学 内科学 医学 癌症研究 生物 计算机科学 遗传学 基因 古生物学 程序设计语言
作者
Hui Xu,Shuang Chen,Jing Li,Siyuan Weng,Yuqing Ren,Yuyuan Zhang,Libo Wang,Long Liu,Chunguang Guo,Zhe Xing,Peng Luo,Quan Cheng,Xinwei Han,Zaoqu Liu
出处
期刊:Journal of Proteome Research [American Chemical Society]
卷期号:23 (2): 760-774
标识
DOI:10.1021/acs.jproteome.3c00626
摘要

Approximately 10–15% of stage II and 25–30% of stage III colorectal cancer (CRC) patients experience recurrence within 5 years after surgery, and existing taxonomies are insufficient to meet the needs of clinical precision treatment. Thus, robust biomarkers and precise management were urgently required to stratify stage II and III CRC and identify potential patients who will benefit from postoperative adjuvant therapy. Alongside, interactions of ligand–receptor pairs point to an emerging direction in tumor signaling with far-reaching implications for CRC, while their impact on tumor subtyping has not been elucidated. Herein, based on multiple large-sample multicenter cohorts and perturbations of the ligand–receptor interaction network, four well-characterized ligand–receptor-driven subtypes (LRDS) were established and further validated. These molecular taxonomies perform with unique heterogeneity in terms of molecular characteristics, immune and mutational landscapes, and clinical features. Specifically, MEIS2, a key LRDS4 factor, performs significant associations with proliferation, invasion, migration, and dismal prognosis of stage II/III CRC, revealing promising directions for prognostic assessment and individualized treatment of CRC patients. Overall, our study sheds novel insights into the implications of intercellular communication on stage II/III CRC from a ligand–receptor interactome perspective and revealed MEIS2 as a key factor in the aggressive progression and prognosis for stage II/III CRC.
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