0.1 THz exposure affects primary hippocampus neuron gene expression via alternating transcription factor binding

转录因子 基因表达 基因 DNA结合位点 分子生物学 细胞生物学 生物 遗传学 发起人
作者
Sen Shang,Xueyuan Wu,Qi Zhang,Jiping Zhao,Erling Hu,Leilei Wang,Xiaoyun Lu
出处
期刊:Biomedical Optics Express [The Optical Society]
卷期号:12 (6): 3729-3729 被引量:12
标识
DOI:10.1364/boe.426928
摘要

In recent years, many studies have been conducted to investigate the influence of terahertz (THz) radiation on the gene expression in various cell types, but the underling molecular mechanism has not yet been fully revealed. In this study, we explored the effects of 0.1 THz radiation on the gene expression in primary neuron cells through RNA-seq analysis. 111 up-regulated and 54 down-regulated genes were identified. Several biomolecule binding related categories such as “long-chain fatty acid binding”, “tropomyosin binding”, “BMP receptor binding”, as well as “GTPase binding” and “phospholipid binding” were enriched by GO analysis. Moreover, the GSEA analysis indicated that genes encoding protein biosynthetic machinery ribosome were up-regulated by 0.1 THz irradiation. In addition, we demonstrated that the binding efficiency of a transcription factor (TF) AP-1 with its transcription factor binding site (TFBS) in DNA was reduced by THz irradiation, which suggested that THz irradiation might affect the interaction between TFs with DNA and consequently regulate the gene expression. Our results provide new insights into the biological effects of terahertz irradiation.
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