[Diagonsis establishment of fluorescen quantitative PCR assay for pseudorabies wild-type virus and vaccine virus].

伪狂犬病 实时聚合酶链反应 塔克曼 病毒 病毒学 生物 分子生物学 聚合酶链反应 检出限 DNA 化学 基因 色谱法 遗传学
作者
Li Zhao,Bao-An Cui,Hong‐Ying Chen,Zhanyong Wei,Lan‐Lan Zheng,Xiaoli Lü,Yanyan Jia,Zhao Xuyong
标识
摘要

We designed two pairs of primers and their corresponding TaqMan probes according to gH, gE gene of PRV. By optimizing the probe's concentration, Mg2+ concentration, primers concentration and sample DNA extraction, real-time fluorescent quantitative PCR (FQ-PCR) which can quickly identity field virus and vaccine virus of PRV was established. According to our results, the dynamic range of the FQ-PCR assay is between 10 x 10(1) copies/microL and 10 x l0(8) copies/microL, and the detection limit of FQ-PCR is 1.0 x 10(1) copies/microL, which is 100 fold higher than that of conventional PCR. We detected 60 doubtful tissue samples using the FQ-PCR assay, serum neutralization and conventional PCR. In conclusion, the FQ-PCR method is rapid, sensitive, specific and accurate, and can be used to detect field strains of PRV rapidly. The closed-tube format of the assay minimized the risk of contamination of subsequent reaction and the assay can be performed in 2 h or less. Development of real-time quantitative PCR provides the basis for the early and rapid detection and analyzing quantitatively the infectious degree of PRV.

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