TRUPATH, an open-source biosensor platform for interrogating the GPCR transducerome

G蛋白偶联受体 生物传感器 计算生物学 纳米技术 生物 化学 药物发现 信号转导 生物信息学 生物化学 材料科学
作者
Reid H. J. Olsen,Jeffrey F. DiBerto,Justin G. English,Alexis M. Glaudin,B. Krumm,Samuel T. Slocum,Tao Che,Ariana C. Gavin,John D. McCorvy,Bryan L. Roth,Ryan T. Strachan
出处
期刊:Nature Chemical Biology [Springer Nature]
卷期号:16 (8): 841-849 被引量:388
标识
DOI:10.1038/s41589-020-0535-8
摘要

G-protein-coupled receptors (GPCRs) remain major drug targets, despite our incomplete understanding of how they signal through 16 non-visual G-protein signal transducers (collectively named the transducerome) to exert their actions. To address this gap, we have developed an open-source suite of 14 optimized bioluminescence resonance energy transfer (BRET) Gαβγ biosensors (named TRUPATH) to interrogate the transducerome with single pathway resolution in cells. Generated through exhaustive protein engineering and empirical testing, the TRUPATH suite of Gαβγ biosensors includes the first Gα15 and GαGustducin probes. In head-to-head studies, TRUPATH biosensors outperformed first-generation sensors at multiple GPCRs and in different cell lines. Benchmarking studies with TRUPATH biosensors recapitulated previously documented signaling bias and revealed new coupling preferences for prototypic and understudied GPCRs with potential in vivo relevance. To enable a greater understanding of GPCR molecular pharmacology by the scientific community, we have made TRUPATH biosensors easily accessible as a kit through Addgene. Development of BRET sensors for nearly all major G proteins show that GPCR–G-protein coupling ranges from promiscuous to extremely specific, Switch III is a novel site for G-protein engineering, and optimal donor–acceptor positioning is non-obvious.
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