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Rhizorhabdus phycosphaerae sp. nov., isolated from the phycosphere of Microcystis aeruginosa

16S核糖体RNA 生物 磷脂酰甘油 拉伤 铜绿微囊藻 基因组DNA 细菌 脂肪酸 微生物学 DNA 生物化学 磷脂 蓝藻 磷脂酰胆碱 遗传学 解剖
作者
Minkyung Kim,Junshik Bae,Woojun Park
出处
期刊:International Journal of Systematic and Evolutionary Microbiology [Microbiology Society]
卷期号:72 (4) 被引量:4
标识
DOI:10.1099/ijsem.0.005324
摘要

A novel bacterial strain, designated MK52T, was isolated from the phycosphere of Microcystis aeruginosa. Strain MK52T is a Gram-stain-negative, pink-pigmented, rod-shaped, strictly aerobic bacterium. In 16S rRNA phylogenetic analysis, the MK52T strain was most closely related to Rhizorhabdus wittichii RW1T (98.66 %) and Rhizorhabdus histidinilytica UM2T (98.51 %). The genomic DNA G+C content of strain MK52T was calculated to be 65.5 mol%. The average nucleotide identity values of strain MK52T with R. wittichii RW1T and R. histidinilytica UM2T were 80.35 and 80.23 %, respectively, with digital DNA-DNA hybridization values of 23.6 and 22.9 %, respectively, and average amino acid identities of 75.59 and 75.79 %, respectively. The major isoprenoid quinone was Q-10, and the predominant polar lipids were diphosphatidylglycerol, phosphatidylglycerol, phosphatidylethanolamine and sphingoglycolipid. Fatty acid methyl ether analysis showed that summed feature 8 (C18 : 1 ω7c and/or C18 : 1 ω6c) was the main cellular fatty acid in strain MK52T. Strain MK52T cells grew at 21-34 °C (optimum, 30 °C), pH 5-8 (optimum, pH 7) and with 0-2 % (w/v) NaCl (optimum, 0.5 % NaCl). Rhizorhabdus phycosphaerae sp. nov. is proposed as a new species (=KCTC 72877T=DSM 111424T) based on its genotypic and phenotypic characteristics.
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