Domestication and geographic origin of Oryza sativa in China: insights from multilocus analysis of nucleotide variation of O. sativa and O. rufipogon

驯化 生物 粳稻 野生稻 水稻 遗传多样性 基因组 植物 遗传学 基因 人口 人口学 社会学
作者
Wei Xin,Weihua Qiao,You‐Tao Chen,Rongsheng Wang,Lirong Cao,Wan‐Xia Zhang,Nannan Yuan,Zichao Li,Hanlai Zeng,Qingwen Yang
出处
期刊:Molecular Ecology [Wiley]
卷期号:21 (20): 5073-5087 被引量:37
标识
DOI:10.1111/j.1365-294x.2012.05748.x
摘要

Abstract Previous studies have indicated that C hina is one of the domestication centres of A sian cultivated rice ( O ryza sativa ), and common wild rice ( O . rufipogon ) is the progenitor of O . sativa . However, the number of domestication times and the geographic origin of A sian cultivated rice in C hina are still under debate. In this study, 100 accessions of A sian cultivated rice and 111 accessions of common wild rice in C hina were selected to examine the relationship between O . sativa and O . rufipogon and thereby infer the domestication and evolution of O . sativa in C hina through sequence analyses of six gene regions, trn C ‐ycf6 in chloroplast genomes, cox3 in mitochondrial genomes and ITS , E hd1 , W axy , H d1 in nuclear genomes. The results indicated that the two subspecies of O . sativa (indica and japonica) were domesticated independently from different populations of O . rufipogon with gene flow occurring later from japonica to indica; S outhern C hina was the genetic diversity centre of O . rufipogon , and the P earl R iver basin near the T ropic of C ancer was the domestication centre of O . sativa in C hina.
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