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Circulating RNA Profiling in Postreperfusion Plasma From Kidney Transplant Recipients

小RNA 下调和上调 生物 微泡 移植 基因表达谱 核糖核酸 基因 基因本体论 基因表达 细胞生物学 男科 癌症研究 医学 内科学 内分泌学 遗传学
作者
Sang In Lee,Hyojun Park,Sung Joo Kim,Kyo Won Lee,Du Yeon Shin,Jin Kyung Son,Jung Hwa Hong,Seung Han Kim,Hye Jin Cho,Jae Berm Park,Tae Min Kim
出处
期刊:Transplantation Proceedings [Elsevier]
卷期号:53 (10): 2853-2865 被引量:4
标识
DOI:10.1016/j.transproceed.2021.09.044
摘要

Ischemia/reperfusion injury (IRI) is inevitable in kidney transplantation (KT) and may lead to impaired tubular epithelial cell function and reduce graft function and survival. Renal IRI is a complex cellular and molecular event; therefore, investigating the genetic or molecular pathways associated with the early phase of KT would improve our understanding of IRI in KT. MicroRNAs (miRNAs) play a critical role in various pathologic events associated with IRI.We compared the expression profile of miRNAs extracted from 2 blood plasma samples, 1 from periphery and the other form gonadal veins immediately after reperfusion, in a total 5 cases of KT.We observed that the total RNA yield was higher in postreperfusion plasma and that a subset of miRNAs was upregulated (miR-let-7a-3p, miR-143-3p, and miR-214-3p) or downregulated (let-7d-3p, let-7d-3p, miR-1246, miR-1260b, miR-1290, and miR-130b-3p) in postreperfusion plasma. Gene ontology analyses revealed that these subsets target different biological functions. Twenty-four predicted genes were commonly targeted by the upregulated miRNAs, and gene ontology enrichment and pathway analyses revealed that these were associated with various cellular activities such as signal transduction or with components such as exosomes and membranous organelles.We present 2 subsets of miRNAs that were differentially upregulated or downregulated in postreperfusion plasma. Our findings may enhance our understanding of miRNA-mediated early molecular events related to IRI in KT.
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