SurvLIMEpy: A Python package implementing SurvLIME

Python(编程语言) 计算机科学 R包 开源 可视化 数据挖掘 机器学习 人工智能 计算科学 软件 程序设计语言
作者
Cristian Pachón-García,Carlos Hernández-Pérez,Pedro Delicado,Verónica Vilaplana
出处
期刊:Expert Systems With Applications [Elsevier BV]
卷期号:237: 121620-121620 被引量:4
标识
DOI:10.1016/j.eswa.2023.121620
摘要

In this paper we present SurvLIMEpy, an open-source Python package that implements the SurvLIME algorithm. This method allows to compute local feature importance for machine learning algorithms designed for modelling Survival Analysis data. The presented implementation uses a matrix-wise formulation, which allows to speed up the execution time. Additionally, SurvLIMEpy assists the user with visualisation tools to better understand the result of the algorithm. The package supports a wide variety of survival models, from the Cox Proportional Hazards Model to deep learning models such as DeepHit or DeepSurv. Two types of experiments are presented in this paper. First, by means of simulated data, we study the ability of the algorithm to capture the importance of the features. Second, we use three open source survival datasets together with a set of survival algorithms in order to demonstrate how SurvLIMEpy behaves when applied to different models.
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