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Potential MAO‐B Inhibitors from Cissampelos capensis L.f.: ADMET, Molecular Docking, Dynamics, and DFT Insights

化学 对接(动物) 李宾斯基五定律 分子动力学 密度泛函理论 体内 生物利用度 立体化学 药理学 计算生物学 生物化学 计算化学 基因 生物信息学 遗传学 生物 医学 护理部
作者
Mohammad G. Al‐Thiabat,Mohit Agrawal,Kantrol Kumar Sahu,Maram B. Alhawarri,Katreen Banisalman,Ghazi A. Al Jabal,Haya Saleh Elqaderi
出处
期刊:Chemistry & Biodiversity [Wiley]
标识
DOI:10.1002/cbdv.202402351
摘要

This study explores the therapeutic potential of three proaporphine alkaloids-cissamaline, cissamanine, and cissamdine, which were recently isolated from Cissampelos capensis L.f., against Parkinson's disease (PD). Using computational techniques, we investigated their efficacy as inhibitors of a key protein in PD. ADMET analysis demonstrated that these alkaloids conform to the Lipinski, Pfizer, Golden Triangle, and GSK rules, indicating favorable safety, oral bioavailability, and a high probability of passing the human intestinal and blood-brain barriers. They were neither substrates nor inhibitors of any CYP enzymes tested, indicating minimal metabolic interference and an enhanced safety profile. Molecular docking studies revealed binding energies of -9.05 kcal/mol (cissamaline), -9.95 kcal/mol (cissamanine), and -10.65 kcal/mol (cissamdine) against MAO-B, a critical PD target, surpassing the control (zonisamide, -6.96 kcal/mol). The molecular interaction analyses were also promising, with interactions comparable to the control. Molecular dynamics (MD) simulations confirmed stable protein-ligand interactions, with root-mean-square deviation (RMSD) values ranging from 1.03 Å to 3.92 Å, root-mean-square fluctuation (RMSF) values remaining below 1.14 Å, and radius of gyration (RGyr) values between 20.20 Å and 20.50 Å, indicating compact structures. Hydrogen bonding analysis revealed maximum hydrogen bond counts of 6 (cissamanine), 5 (cissamaline), and 4 (cissamdine), demonstrating robust interactions with MAO-B. Density Functional Theory (DFT) calculations revealed the highest electrophilicity (ω =0.151), highest electron affinity (EA =0.075), and smallest HOMO-LUMO gap (ΔE =0.130) for cissamanine, indicating enhanced reactivity. These results advocate for further in vitro and in vivo studies to evaluate the compounds' potential as PD therapeutics.

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