The world according to GARP transcription factors

生物 MYB公司 转录因子 生物钟 植物发育 基因 细胞生物学 计算生物学 遗传学 抄写(语言学) 语言学 哲学
作者
Alaeddine Safi,Anna Medici,Wojciech Szponarski,Sandrine Ruffel,Benoı̂t Lacombe,Gabriel Krouk
出处
期刊:Current Opinion in Plant Biology [Elsevier]
卷期号:39: 159-167 被引量:83
标识
DOI:10.1016/j.pbi.2017.07.006
摘要

Plant specific GARP transcription factor family (made of ARR-B and G2-like) contains genes with very diverse in planta functions: nutrient sensing, root and shoot development, floral transition, chloroplast development, circadian clock oscillation maintenance, hormonal transport and signaling. In this work we review: first, their structural but distant relationships with MYB transcription factors, second, their role in planta, third, the diversity of their Cis-regulatory elements, fourth, their potential protein partners. We conclude that the GARP family may hold keys to understand the interactions between nutritional signaling pathways (nitrogen and phosphate at least) and development. Understanding how plant nutrition and development are coordinated is central to understand how to adapt plants to an ever-changing environment. Consequently GARPs are likely to attract increasing research attentions, as they are likely at the crossroads of these fundamental processes.
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