Single-cell and spatial transcriptome analysis reveals the cellular heterogeneity of liver metastatic colorectal cancer

转录组 结直肠癌 转移 癌症研究 生物 CD8型 细胞 癌症 免疫系统 免疫学 基因表达 基因 遗传学
作者
Fei Wang,Jie Long,Liang Li,Zixin Wu,Tian-Tian Da,Xiaoqing Wang,Chuan Huang,Yihua Jiang,Xueqing Yao,Haiqing Ma,Zhe‐Xiong Lian,Z Zhao,Jie Cao
出处
期刊:Science Advances [American Association for the Advancement of Science (AAAS)]
卷期号:9 (24) 被引量:50
标识
DOI:10.1126/sciadv.adf5464
摘要

In this study, we comprehensively charted the cellular landscape of colorectal cancer (CRC) and well-matched liver metastatic CRC using single-cell and spatial transcriptome RNA sequencing. We generated 41,892 CD45 − nonimmune cells and 196,473 CD45 + immune cells from 27 samples of six CRC patients, and found that CD8_CXCL13 and CD4_CXCL13 subsets increased significantly in liver metastatic samples that exhibited high proliferation ability and tumor-activating characterization, contributing to better prognosis of patients. Distinct fibroblast profiles were observed in primary and liver metastatic tumors. F3 + fibroblasts enriched in primary tumors contributed to worse overall survival by expressing protumor factors. However, MCAM + fibroblasts enriched in liver metastatic tumors might promote generation of CD8_CXCL13 cells through Notch signaling. In summary, we extensively analyzed the transcriptional differences of cell atlas between primary and liver metastatic tumors of CRC by single-cell and spatial transcriptome RNA sequencing, providing different dimensions of the development of liver metastasis in CRC.
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