Prediction of Small-Molecule Developability Using Large-Scale In Silico ADMET Models

生物信息学 化学空间 判别式 药物发现 分子描述符 比例(比率) 化学 系列(地层学) 化学信息学 计算生物学 机器学习 药品 数量结构-活动关系 人工智能 计算机科学 数据挖掘 计算化学 药理学 生物化学 生物 古生物学 物理 量子力学 基因
作者
Maximilian Beckers,Noé Sturm,Finton Sirockin,Nikolas Fechner,Nikolaus Stiefl
出处
期刊:Journal of Medicinal Chemistry [American Chemical Society]
卷期号:66 (20): 14047-14060 被引量:10
标识
DOI:10.1021/acs.jmedchem.3c01083
摘要

Early in silico assessment of the potential of a series of compounds to deliver a drug is one of the major challenges in computer-assisted drug design. The goal is to identify the right chemical series of compounds out of a large chemical space to then subsequently prioritize the molecules with the highest potential to become a drug. Although multiple approaches to assess compounds have been developed over decades, the quality of these predictors is often not good enough and compounds that agree with the respective estimates are not necessarily druglike. Here, we report a novel deep learning approach that leverages large-scale predictions of ∼100 ADMET assays to assess the potential of a compound to become a relevant drug candidate. The resulting score, which we termed bPK score, substantially outperforms previous approaches and showed strong discriminative performance on data sets where previous approaches did not.

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