Solvent‐induced proteome profiling for proteomic quantitation and target discovery of small molecular drugs

蛋白质组 蛋白质组学 计算生物学 化学 小分子 生物 生物化学 基因
作者
Chengli Yu,Xiuzhen Chen,Weiwei Xu,Simin Li,Qian Chai,Yinan Zhang
出处
期刊:Proteomics [Wiley]
卷期号:23 (12) 被引量:7
标识
DOI:10.1002/pmic.202200281
摘要

Abstract Target identification by modification‐free proteomic approaches can potentially reveal the pharmacological mechanism of small molecular compounds. By combining the recent solvent‐induced protein precipitation (SIP) method with TMT‐labeling quantitative proteomics, we propose solvent‐induced proteome profiling (SIPP) approach to identify small molecule–protein interactions. The SIPP approach enables to depict denaturation curves of the target protein by varying concentrations of organic solvents to induce unfolding and precipitation of the cellular proteome. By using this approach, we have successfully identified the known targets of market drugs and natural products and extended the proteome information of SIP for target identification.
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