Combinations of PCR and Isothermal Amplification Techniques Are Suitable for Fast and Sensitive Detection of SARS-CoV-2 Viral RNA

病毒学 环介导等温扩增 严重急性呼吸综合征冠状病毒2型(SARS-CoV-2) 2019年冠状病毒病(COVID-19) 2019-20冠状病毒爆发 核糖核酸 生物 计算生物学 医学 基因 遗传学 DNA 爆发 病理 传染病(医学专业) 疾病
作者
Dmitriy A. Varlamov,Konstantin А. Blagodatskikh,Е. В. Смирнова,Vladimir M. Kramarov,Konstantin B. Ignatov
出处
期刊:Frontiers in Bioengineering and Biotechnology [Frontiers Media SA]
卷期号:8 被引量:20
标识
DOI:10.3389/fbioe.2020.604793
摘要

The newly identified coronavirus, severe acute respiratory syndrome coronavirus 2 (SARS-CoV-2), causes coronavirus disease 2019 (COVID-19) and has affected over 25 million people worldwide as of August 31, 2020. To aid in the development of diagnostic kits for rapid and sensitive detection of the virus, we evaluated a combination of polymerase chain reaction (PCR) and isothermal nucleic acid amplification techniques. Here, we compared conventional PCR and loop-mediated isothermal amplification (LAMP) methods with hybrid techniques such as polymerase chain displacement reaction (PCDR) and a newly developed PCR-LAMP method. We found that the hybrid methods demonstrated higher sensitivity and assay reaction rates than those of the classic LAMP and PCR techniques and can be used to for SARS-CoV-2 detection. The proposed methods based on the modern hybrid amplification techniques markedly improve virus detection and, therefore, can be extremely useful in the development of new diagnostic kits.
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