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Quantum Variational Transition State Theory for Hydrogen Tunneling in Enzyme Catalysis

动力学同位素效应 过渡态理论 量子隧道 化学 耗散系统 动能 热力学 化学物理 过渡状态 催化作用 密度泛函理论 反应速率 酶催化 计算化学 动力学 反应速率常数 原子物理学 物理 凝聚态物理 量子力学 有机化学
作者
Eli Pollak
出处
期刊:Journal of Physical Chemistry B [American Chemical Society]
卷期号:116 (43): 12966-12971 被引量:11
标识
DOI:10.1021/jp307556j
摘要

Experiments in recent years have shown that there is a large kinetic isotope effect in the rate of transfer of hydrogen or deuterium in enzymatic reactions of soybean lipoxygenase-1. The kinetic isotope effect (KIE) is only weakly temperature dependent but varies significantly in the presence of mutants whose functional groups are located rather far from the reaction center. In this paper we suggest that variational transition state theory as applied to dissipative systems, above the crossover temperature between deep tunneling and thermal activation, may be used as a paradigm for understanding the dynamics of these reactions. We find that the theory fits the experimental data rather well. The effects of different mutants are readily interpreted in terms of the friction they exert on the reaction center. Increasing the distal functional group increases the friction and thus lowers the kinetic isotope effect.

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