Detection of Cadmium(II) in Aquatic Products Using a Rolling-Circle Amplification-Coupled Ratio Fluorescent Probe Based on an Aptamer–Peptide Conjugate

适体 结合 荧光 检出限 化学 组合化学 滚动圆复制 生物传感器 色谱法 生物物理学 生物化学 生物 分子生物学 DNA 有机化学 量子力学 数学分析 物理 DNA复制 数学
作者
Kaimin Peng,Jiahao Sha,Xinyu Fang,Mengqiu Li,Jingsong Yu,Liling Hao,Fei Xu
出处
期刊:Journal of Agricultural and Food Chemistry [American Chemical Society]
卷期号:72 (14): 8167-8179 被引量:3
标识
DOI:10.1021/acs.jafc.3c08636
摘要

The existing aptamers for cadmium (Cd2+), the common toxic heavy metal contaminant in food, cannot meet the requirements for detecting Cd2+ in rapid detection methods. In previous work, we found that coupling aptamer–peptide conjugates (APCs) with peptides and aptamers can provide a less disruptive method with a significantly improved affinity. Moreover, we found that the spatial conformation of aptamers and peptides is crucial for obtaining proper affinity in APC. Therefore, we describe a simple design strategy to obtain a series of APCs with different affinities by designing peptide orientations (N-terminal, C-terminal). The best affinity was found for APC(C1–N) with a binding constant (Ka) of 2.23 × 106 M–1, indicating that the APC(C1–N) affinity was significantly increased by 829.17% over aptamer. Finally, a rolling-circle amplification (RCA)-coupled ratio fluorescence-based biosensor for Cd2+ detection was established with a detection limit of 0.0036 nM, which has great potential for practical aquatic product detection.
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