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Defluviimonas sediminis sp. nov., isolated from mangrove sediment

生物 16S核糖体RNA 系统发育树 拉伤 红树林 基因组DNA 磷脂酰甘油 微生物学 植物 细菌 基因 遗传学 磷脂 生态学 解剖 磷脂酰胆碱
作者
Lirui Liu,Jiayi Li,Yuhan Huang,Jie Pan,Meng Li
出处
期刊:International Journal of Systematic and Evolutionary Microbiology [Microbiology Society]
卷期号:73 (7)
标识
DOI:10.1099/ijsem.0.005975
摘要

A Gram-stain-negative, facultatively aerobic, motile and ovoid- to rod-shaped bacterium, designated as FT324T, was isolated from a surface mangrove sediment sample from Shenzhen, PR China. The taxonomic position of strain FT324T was determined by a combination of phylogenetic, physiological, biochemical and chemotaxonomic analyses. Strain FT324T grew at 20-40 °C (optimum, 30-37 °C), pH 5.0-9.0 (optimum, pH 8.0) and in the presence of 0-3 % (w/v) NaCl (optimum, 1 %). Its full-length 16S rRNA gene sequence was the most similar to Frigidibacter oleivorans XJ4T (97.4 %), followed by Defluviimonas denitrificans DSM 18921T (96.62 %), Pseudothioclava arenosa CAU 1312T (96.54 %) and Defluviimonas nitratireducens DL5-4T (96.47 %). The major fatty acids (>10 %) of FT324T were C19 : 0 cyclo ω8c (51.9 %) and summed feature 8(29.6 %). The predominant respiratory quinone was Q-10. Its polar lipid profile contained phosphatidylethanolamine, phosphatidylmethylethanolamine, phosphatidylglycerol, diphosphatidylglycerol, one unidentified aminolipid, one unidentified lipid and two unidentified phospholipids. Its estimated genome size was 4 294 115 bp and the genomic DNA G+C content was 69.6 mol%. Based on its distinct phenotypic, chemotaxonomic and phylogenetic characteristics, strain FT324T should represent a novel species of the genus Defluviimonas, for which the name Defluviimonas sediminis sp. nov. is proposed (=MCCC 1K07685T=KCTC 92477T).
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