Exponential Amplification-Induced Activation of CRISPR/Cas9 for Sensitive Detection of Exosomal miRNA

化学 清脆的 Cas9 亚基因组mRNA 小RNA DNA 荧光染料 微泡 引导RNA 计算生物学 细胞生物学 分子生物学 实时聚合酶链反应 生物化学 基因 生物
作者
Mengyang Zhou,Chao Li,Rong Wei,Haoyu Wang,Haojie Jia,Chao Yan,Lin Huang
出处
期刊:Analytical Chemistry [American Chemical Society]
卷期号:96 (10): 4322-4329 被引量:1
标识
DOI:10.1021/acs.analchem.4c00313
摘要

As an important component of highly heterogeneous exosomes, exosomal microRNAs (miRNAs) have great potential as noninvasive biomarkers for cancer diagnosis. Therefore, a sensitive and simple sensor is the key for its clinical application. Herein, we designed an exponential amplification reaction (EXPAR) to induce the reactivation of the CRISPR-associated protein 9/small guide RNA (Cas9/sgRNA) complex, thus achieving sensitive and visual exosomal miRNAs-21 (miR-21) fluorescence sensing. In this design, we inactivated the sgRNA by hybridizing sgRNA and blocker DNA. Then, we used a trigger DNA to hybridize with miR-21 and produced a lot of activated DNA by EXPAR. Those activated DNA further hybridized with blocker DNA and released the free sgRNA to form the activated Cas9/sgRNA complex. Based on the quick cleavage of activated Cas9/sgRNA complex, the reporter DNA labeled by SYBR Green I was released from the surface of the magnetic nanoparticles (MNPs) into the supernatant, and thus was used to sensitively quantify the miRNAs concentration with a limit of detection of 3 × 10
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