Graph-Based Deep Learning Models for Thermodynamic Property Prediction: The Interplay between Target Definition, Data Distribution, Featurization, and Model Architecture

计算机科学 图形 财产(哲学) 人工智能 理论计算机科学 数据挖掘 认识论 哲学
作者
Bowen Deng,Thijs Stuyver
出处
期刊:Journal of Chemical Information and Modeling [American Chemical Society]
标识
DOI:10.1021/acs.jcim.4c02014
摘要

In this contribution, we examine the interplay between target definition, data distribution, featurization approaches, and model architectures on graph-based deep learning models for thermodynamic property prediction. Through consideration of five curated data sets, exhibiting diversity in elemental composition, multiplicity, charge state, and size, we examine the impact of each of these factors on model accuracy. We observe that target definition, i.e., using formation instead of atomization energy/enthalpy, is a decisive factor, and so is a careful selection of the featurization approach. Our attempts at directly modifying model architectures result in more modest, though not negligible, accuracy gains. Remarkably, we observe that molecule-level predictions tend to outperform atom-level increment predictions, in contrast to previous findings. Overall, this work paves the way toward the development of robust graph-based thermodynamic model architectures with more universal capabilities, i.e., architectures that can reach excellent accuracy across data sets and compound domains.

科研通智能强力驱动
Strongly Powered by AbleSci AI
科研通是完全免费的文献互助平台,具备全网最快的应助速度,最高的求助完成率。 对每一个文献求助,科研通都将尽心尽力,给求助人一个满意的交代。
实时播报
刚刚
小二郎应助愉快的自行车采纳,获得10
刚刚
云澈完成签到,获得积分10
刚刚
1秒前
2秒前
嘟嘟发布了新的文献求助10
2秒前
2秒前
科研通AI6应助高斯采纳,获得30
2秒前
回穆完成签到 ,获得积分10
3秒前
不爱科研发布了新的文献求助10
3秒前
3秒前
如果天气好的话完成签到,获得积分10
4秒前
4秒前
曹飒丽完成签到,获得积分10
4秒前
清秀翠风完成签到,获得积分10
5秒前
激昂的元绿完成签到,获得积分10
6秒前
xiami完成签到,获得积分10
6秒前
6秒前
110o完成签到,获得积分10
6秒前
6秒前
7秒前
7秒前
孤独的自中完成签到 ,获得积分10
7秒前
ilihe应助踏实凝云采纳,获得10
8秒前
8秒前
量子星尘发布了新的文献求助10
8秒前
8秒前
8秒前
9秒前
10秒前
CipherSage应助123采纳,获得10
10秒前
猫咪完成签到,获得积分10
10秒前
aaaaaa完成签到,获得积分10
10秒前
上官若男应助撒玉采纳,获得10
10秒前
科研通AI6应助子辰采纳,获得10
11秒前
爆米花应助子辰采纳,获得10
11秒前
12秒前
BBy_Smile发布了新的文献求助10
13秒前
张雨露完成签到 ,获得积分10
13秒前
13秒前
高分求助中
(应助此贴封号)【重要!!请各用户(尤其是新用户)详细阅读】【科研通的精品贴汇总】 10000
《药学类医疗服务价格项目立项指南(征求意见稿)》 880
Stop Talking About Wellbeing: A Pragmatic Approach to Teacher Workload 800
花の香りの秘密―遺伝子情報から機能性まで 800
3rd Edition Group Dynamics in Exercise and Sport Psychology New Perspectives Edited By Mark R. Beauchamp, Mark Eys Copyright 2025 600
1st Edition Sports Rehabilitation and Training Multidisciplinary Perspectives By Richard Moss, Adam Gledhill 600
Terminologia Embryologica 500
热门求助领域 (近24小时)
化学 材料科学 生物 医学 工程类 计算机科学 有机化学 物理 生物化学 纳米技术 复合材料 内科学 化学工程 人工智能 催化作用 遗传学 数学 基因 量子力学 物理化学
热门帖子
关注 科研通微信公众号,转发送积分 5618980
求助须知:如何正确求助?哪些是违规求助? 4703923
关于积分的说明 14924415
捐赠科研通 4758994
什么是DOI,文献DOI怎么找? 2550336
邀请新用户注册赠送积分活动 1513125
关于科研通互助平台的介绍 1474401