Identification of pathogenic genes and transcription factors in vitiligo

白癜风 小桶 索克斯10 遗传学 生物 基因 微阵列 计算生物学 医学 转录因子 基因表达 转录组
作者
Xiangfeng Yuan,Dan Meng,Peihua Cao,Lina Sun,Yunyan Pang,Yuan Li,Xing Wang,Zengxiang Luo,Li Zhang,Guoyan Liu
出处
期刊:Dermatologic Therapy [Wiley]
卷期号:32 (5) 被引量:17
标识
DOI:10.1111/dth.13025
摘要

Our study aimed to identify the key genes and upstream regulators in vitiligo. To screen the pathogenic genes of vitiligo, an integrated analysis was performed by using the microarray datasets in vitiligo derived from the Gene Expression Omnibus (GEO) database. The functional annotation and potential pathways of differentially expressed genes (DEGs) were further explored by Gene Ontology (GO) and Kyoto Encyclopedia of Genes and Genomes (KEGG) enrichment analyses. We constructed a vitiligo-specific transcriptional regulatory network to identify crucial transcriptional factors that target the DEGs in vitiligo. From two GEO datasets, we identified 1863 DEGs (744 downregulated DEGs and 1,119 upregulated DEGs [false discovery rate < 0.05, |Combined.ES| > 1]) between lesional tissues and nonlesional tissues. GO and KEGG analyses revealed that ubiquitin-mediated proteolysis and the endoplasmic reticulum were significantly enriched pathways for DEGs. The expressions of premelanosome (PMEL), melan-A (MLANA), dopachrome tautomerase (DCT), SRY-boxtranscription factor 10 (SOX10), tyrosinase-related protein 1 (TYRP1), and melanocortin 1 receptor (MC1R) were shown to be involved in the pathogenesis of vitiligo. We concluded that PMEL, MLANA), DCT, SOX10, TYRP1, and MC1R may play a role in vitiligo, among which TYRP1 and MC1R are regulated by forkhead box J2 (FOXJ2). Our finding may contribute to the development of new potential biomarkers, reveal the underlying pathogenesis of vitiligo, and identify novel therapeutic targets for vitiligo.
最长约 10秒,即可获得该文献文件

科研通智能强力驱动
Strongly Powered by AbleSci AI
更新
PDF的下载单位、IP信息已删除 (2025-6-4)

科研通是完全免费的文献互助平台,具备全网最快的应助速度,最高的求助完成率。 对每一个文献求助,科研通都将尽心尽力,给求助人一个满意的交代。
实时播报
Sun1c7完成签到,获得积分10
1秒前
东郭一斩完成签到,获得积分10
2秒前
Vinaceliu完成签到,获得积分10
3秒前
安安完成签到 ,获得积分10
3秒前
Hightowerliu18完成签到,获得积分10
4秒前
研友_VZG7GZ应助在途中采纳,获得10
4秒前
嘻嘻完成签到 ,获得积分10
4秒前
小知了完成签到,获得积分10
5秒前
LLL完成签到,获得积分10
5秒前
又是一年完成签到,获得积分10
6秒前
可露丽完成签到,获得积分10
6秒前
JusT完成签到,获得积分0
8秒前
qin完成签到,获得积分10
10秒前
10秒前
ash完成签到,获得积分10
11秒前
zhangyuheng完成签到,获得积分10
11秒前
11秒前
bao完成签到,获得积分10
12秒前
黑章鱼保罗完成签到,获得积分10
12秒前
13秒前
13秒前
正直的煎饼完成签到,获得积分10
14秒前
ooo发布了新的文献求助10
15秒前
15秒前
在途中发布了新的文献求助10
15秒前
大胆易巧完成签到 ,获得积分10
16秒前
luo完成签到 ,获得积分10
17秒前
欧皇发布了新的文献求助30
18秒前
合适的寄灵完成签到 ,获得积分10
20秒前
咋取名字发布了新的文献求助10
21秒前
充电宝应助ooo采纳,获得10
21秒前
明亮的青旋完成签到 ,获得积分10
23秒前
MLJ完成签到 ,获得积分10
25秒前
英勇的红酒完成签到 ,获得积分10
25秒前
kong完成签到,获得积分10
26秒前
文静灵阳完成签到 ,获得积分10
27秒前
闪电侠完成签到 ,获得积分10
27秒前
en完成签到,获得积分10
28秒前
Melody完成签到,获得积分10
28秒前
zuijiasunyou完成签到,获得积分10
29秒前
高分求助中
A new approach to the extrapolation of accelerated life test data 1000
Cognitive Neuroscience: The Biology of the Mind 1000
Technical Brochure TB 814: LPIT applications in HV gas insulated switchgear 1000
Immigrant Incorporation in East Asian Democracies 600
Nucleophilic substitution in azasydnone-modified dinitroanisoles 500
不知道标题是什么 500
A Preliminary Study on Correlation Between Independent Components of Facial Thermal Images and Subjective Assessment of Chronic Stress 500
热门求助领域 (近24小时)
化学 材料科学 医学 生物 工程类 有机化学 生物化学 物理 内科学 纳米技术 计算机科学 化学工程 复合材料 遗传学 基因 物理化学 催化作用 冶金 细胞生物学 免疫学
热门帖子
关注 科研通微信公众号,转发送积分 3968578
求助须知:如何正确求助?哪些是违规求助? 3513400
关于积分的说明 11167585
捐赠科研通 3248853
什么是DOI,文献DOI怎么找? 1794499
邀请新用户注册赠送积分活动 875131
科研通“疑难数据库(出版商)”最低求助积分说明 804664