Liquid Chromatography–Mass Spectrometry-Based Tissue Metabolic Profiling Reveals Major Metabolic Pathway Alterations and Potential Biomarkers of Lung Cancer

代谢组学 代谢途径 肺癌 化学 代谢物 癌症研究 生物 病理 生物化学 医学 生物信息学 新陈代谢
作者
Lei You,Yingying Fan,Xinyu Liu,Shujuan Shao,Lei Guo,Hamada A. A. Noreldeen,Zaifang Li,Yang Ouyang,Enyou Li,Xue Pan,Tianyang Liu,Xin Tian,Fei Ye,Xiangnan Li,Guowang Xu
出处
期刊:Journal of Proteome Research [American Chemical Society]
卷期号:19 (9): 3750-3760 被引量:16
标识
DOI:10.1021/acs.jproteome.0c00285
摘要

Unclarified molecular mechanism and lack of practical diagnosis biomarkers hinder the effective treatment of non-small-cell lung cancer. Herein, we performed liquid chromatography–mass spectrometry-based nontargeted metabolomics analysis in 131 patients with their lung tissue pairs to study the metabolic characteristics and disordered metabolic pathways in lung tumor. A total of 339 metabolites were identified in metabolic profiling. Also, 241 differential metabolites were found between lung carcinoma tissues (LCTs) and paired distal noncancerous tissues; amino acids, purine metabolites, fatty acids, phospholipids, and most of lysophospholipids significantly increased in LCTs, while 3-phosphoglyceric acid, phosphoenolpyruvate, 6-phosphogluconate, and citrate decreased. Additionally, pathway enrichment analysis revealed that energy, purine, amino acid, lipid, and glutathione metabolism are markedly disturbed in lung cancer (LCa). Using binary logistic regression, we further defined candidate biomarkers for different subtypes of lung tumor. Xanthine and PC 35:2 were selected as combinational biomarkers for distinguishing benign from malignant lung tumors with a 0.886 area under curve (AUC) value, and creatine, myoinositol and LPE 16:0 were defined as combinational biomarkers for discriminating adenocarcinoma from squamous cell lung carcinoma with a 0.934 AUC value. Overall, metabolic characterization and pathway disturbance demonstrated apparent metabolic reprogramming in LCa. The defined candidate metabolite marker panels are useful for subtyping of lung tumors to assist clinical diagnosis.
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