清晨好,您是今天最早来到科研通的研友!由于当前在线用户较少,发布求助请尽量完整地填写文献信息,科研通机器人24小时在线,伴您科研之路漫漫前行!

Whole-genome analysis of drug-resistant Mycobacterium tuberculosis reveals novel mutations associated with fluoroquinolone resistance

加替沙星 莫西沙星 结核分枝杆菌 氧氟沙星 左氧氟沙星 抗药性 生物 单核苷酸多态性 多重耐药 肺结核 基因 微生物学 基因型 遗传学 病毒学 抗生素 医学 环丙沙星 病理
作者
Pratchakan Chaiyachat,Angkana Chaiprasert,Ditthawat Nonghanphithak,Saijai Smithtikarn,Phalin Kamolwat,Petchawan Pungrassami,Wipa Reechaipichitkul,Rick Twee‐Hee Ong,Yik‐Ying Teo,Kiatichai Faksri
出处
期刊:International Journal of Antimicrobial Agents [Elsevier BV]
卷期号:58 (3): 106385-106385 被引量:9
标识
DOI:10.1016/j.ijantimicag.2021.106385
摘要

Multidrug-resistant and extensively drug-resistant tuberculosis (M/XDR-TB) remains a global public-health challenge. Known mutations in quinolone resistance-determination regions cannot fully explain phenotypic fluoroquinolone (FQ) resistance in Mycobacterium tuberculosis (Mtb). The aim of this study was to look for novel mutations in Mtb associated with resistance to FQ drugs using whole-genome sequencing analysis. Whole-genome sequences of 659 Mtb strains, including 214 with phenotypic FQ resistance and 445 pan-susceptible isolates, were explored for mutations associated with FQ resistance overall and with resistance to individual FQ drugs (ofloxacin, levofloxacin, moxifloxacin and gatifloxacin). Three novel genes (recC, Rv2005c and PPE59) associated with FQ resistance were identified (P < 0.00001 based on screening analysis and absence of relevant mutations in a pan-susceptible validation set of 360 strains). Nine novel single nucleotide polymorphisms (SNPs), including in gyrB (G5383A and G6773A), gyrA (G7892A), recC (G725900C and G726857T/C), Rv2005c (C2251373G, G2251420C and C2251725T) and PPE59 (C3847269T), were used for diagnostic performance analysis. Enhancing the known SNP set with five of these novel SNPs, including gyrA [G7892A (Leu247Leu)], recC [G725900C (Leu893Leu) and G726857T/C (Arg484Arg)], Rv2005c [G2251420C (Pro205Arg)] and PPE59 [C3847269T (Asn35Asn)] increased the sensitivity of detection of FQ-resistant Mtb from 83.2% (178/214) to 86.9% (186/214) while maintaining 100% specificity (360/360). No specific mutation associated with resistance to only a single drug (ofloxacin, levofloxacin, moxifloxacin or gatifloxacin) was found. In conclusion, this study reports possible additional mutations associated with FQ resistance in Mtb.
最长约 10秒,即可获得该文献文件

科研通智能强力驱动
Strongly Powered by AbleSci AI
更新
PDF的下载单位、IP信息已删除 (2025-6-4)

科研通是完全免费的文献互助平台,具备全网最快的应助速度,最高的求助完成率。 对每一个文献求助,科研通都将尽心尽力,给求助人一个满意的交代。
实时播报
38秒前
43秒前
46秒前
紫熊发布了新的文献求助20
48秒前
汉堡包应助栗先森采纳,获得10
50秒前
1分钟前
栗先森发布了新的文献求助10
1分钟前
1分钟前
栗先森完成签到,获得积分10
1分钟前
隐形曼青应助科研通管家采纳,获得10
1分钟前
科研通AI2S应助科研通管家采纳,获得10
1分钟前
1分钟前
量子星尘发布了新的文献求助10
1分钟前
Dreamhappy完成签到,获得积分10
1分钟前
yindi1991完成签到 ,获得积分10
2分钟前
Krim完成签到 ,获得积分10
2分钟前
2分钟前
2分钟前
2分钟前
紫熊完成签到,获得积分10
2分钟前
量子星尘发布了新的文献求助10
3分钟前
CodeCraft应助科研通管家采纳,获得10
3分钟前
十月天秤完成签到,获得积分0
3分钟前
3分钟前
泥娃娃完成签到,获得积分10
3分钟前
natsu401完成签到 ,获得积分10
3分钟前
铜豌豆完成签到 ,获得积分10
4分钟前
ldjldj_2004完成签到 ,获得积分10
4分钟前
方白秋完成签到,获得积分10
4分钟前
青柠完成签到 ,获得积分10
4分钟前
4分钟前
4分钟前
量子星尘发布了新的文献求助10
4分钟前
lyj完成签到 ,获得积分10
4分钟前
叁月二完成签到 ,获得积分10
5分钟前
科研通AI2S应助科研通管家采纳,获得10
5分钟前
5分钟前
蓝华完成签到 ,获得积分10
5分钟前
大医仁心完成签到 ,获得积分10
5分钟前
5分钟前
高分求助中
A new approach to the extrapolation of accelerated life test data 1000
Picture Books with Same-sex Parented Families: Unintentional Censorship 700
ACSM’s Guidelines for Exercise Testing and Prescription, 12th edition 500
Nucleophilic substitution in azasydnone-modified dinitroanisoles 500
不知道标题是什么 500
Indomethacinのヒトにおける経皮吸収 400
Phylogenetic study of the order Polydesmida (Myriapoda: Diplopoda) 370
热门求助领域 (近24小时)
化学 材料科学 医学 生物 工程类 有机化学 生物化学 物理 内科学 纳米技术 计算机科学 化学工程 复合材料 遗传学 基因 物理化学 催化作用 冶金 细胞生物学 免疫学
热门帖子
关注 科研通微信公众号,转发送积分 3976683
求助须知:如何正确求助?哪些是违规求助? 3520770
关于积分的说明 11204819
捐赠科研通 3257565
什么是DOI,文献DOI怎么找? 1798733
邀请新用户注册赠送积分活动 877897
科研通“疑难数据库(出版商)”最低求助积分说明 806629