SLINK: An optimally efficient algorithm for the single-link cluster method

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作者
Robin Sibson
出处
期刊:The Computer Journal [Oxford University Press]
卷期号:16 (1): 30-34 被引量:1132
标识
DOI:10.1093/comjnl/16.1.30
摘要

The SLINK algorithm carries out single-link (nearest-neighbour) cluster analysis on an arbitrary dissimilarity coefficient and provides a representation of the resultant dendrogram which can readily be converted into the usual tree-diagram. The algorithm achieves the theoretical order-of-magnitude bounds for both compactness of storage and speed of operation, and makes the application of the single-link method feasible for a number of OTU's well into the range 103 to 104. The algorithm is easily programmable in a variety of languages including FORTRAN.
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