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High efficiency of mutation detection in type 1 stickler syndrome using a two-stage approach: vitreoretinal assessment coupled with exon sequencing for screening COL2A1

外显子 生物 遗传学 表型 突变 基因 RNA剪接 内含子 剪接 剪接位点突变 选择性拼接 核糖核酸
作者
Allan J. Richards,Maureen Laidlaw,Joanne Whittaker,Becky Treacy,Harjeet Rai,Philip Bearcroft,David Baguley,Arabella Poulson,Alan Ang,John D. Scott,Martin P. Snead
出处
期刊:Human Mutation [Wiley]
卷期号:27 (7): 696-704 被引量:60
标识
DOI:10.1002/humu.20347
摘要

Stickler syndrome is a genetically heterogenous disorder that affects the ocular, skeletal, and auditory systems. To date three genes, COL2A1, COL11A1, and COL11A2, encoding the heterotypic type II/XI collagen fibrils present in vitreous and cartilage have been shown to have mutations that result in Stickler syndrome. As systemic features in this disorder are variable we have used an ophthalmic examination to differentiate those patients with a membranous vitreous phenotype associated with mutations in COL2A1, from other patients who may have mutations in other genes. Gene amplification and exon sequencing was used to screen 50 families or sporadic cases with this membranous phenotype, for mutations in COL2A1. Mutations were detected in 47 (94%) cases consisting of 166 affected and 78 unaffected individuals. We also demonstrate that the predominantly ocular form of type 1 Stickler syndrome is not confined to mutations in the alternatively spliced exon 2. Using splicing reporter constructs we demonstrate that a mutant GC donor splice site in intron 51 can be spliced normally; this contributed to the predominantly ocular phenotype in the family in which it occurred. Hum Mutat 27(7), 696–704, 2006. © 2006 Wiley-Liss, Inc.

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