Extraction of Diatom DNA from Water Samples and Tissues

硅藻 DNA 萃取(化学) DNA提取 基因组DNA 生物 计算生物学 聚合酶链反应 色谱法 化学 生态学 生物化学 基因
作者
Yun-chao Zhou,Bo Wang,Jie Cai,Yu-zhao Xu,Xiaoqi Qin,Soonhoi Ha,Bin Cong,Jianhua Chen,Jianqiang Deng
出处
期刊:Journal of Visualized Experiments [MyJoVE Corporation]
卷期号: (201)
标识
DOI:10.3791/65792
摘要

Diatom testing is an essential auxiliary means in forensic practice to determine whether the corpse drowned in water and to infer the drowning location. Diatom testing is also an important research content in the field of the environment and plankton. The diatom molecular biology testing technology, which focuses on diatom DNA as the primary research object, is a new method of diatom testing. Diatom DNA extraction is the basis of diatom molecular testing. At present, the kits commonly used for diatom DNA extraction are expensive, which increases the cost of carrying out related research. Our laboratory improved the general whole blood genomic DNA rapid extraction kit and obtained a satisfactory diatom DNA extraction effect, thus providing an alternative economical and affordable DNA extraction solution based on glass beads for related research. The diatom DNA extracted using this protocol could satisfy many downstream applications, such as PCR and sequencing.
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