已入深夜,您辛苦了!由于当前在线用户较少,发布求助请尽量完整地填写文献信息,科研通机器人24小时在线,伴您度过漫漫科研夜!祝你早点完成任务,早点休息,好梦!

Improving machine learning force fields for molecular dynamics simulations with fine-grained force metrics

力场(虚构) 分子动力学 计算机科学 稳健性(进化) 理论(学习稳定性) 一般化 集合(抽象数据类型) 机器学习 人工智能 计算化学 化学 数学 生物化学 基因 数学分析 程序设计语言
作者
Zun Wang,Hong-Fei Wu,Lixin Sun,Xinheng He,Zhirong Liu,Bin Shao,Tong Wang,Tie‐Yan Liu
出处
期刊:Journal of Chemical Physics [American Institute of Physics]
卷期号:159 (3) 被引量:13
标识
DOI:10.1063/5.0147023
摘要

Machine learning force fields (MLFFs) have gained popularity in recent years as they provide a cost-effective alternative to ab initio molecular dynamics (MD) simulations. Despite a small error on the test set, MLFFs inherently suffer from generalization and robustness issues during MD simulations. To alleviate these issues, we propose global force metrics and fine-grained metrics from element and conformation aspects to systematically measure MLFFs for every atom and every conformation of molecules. We selected three state-of-the-art MLFFs (ET, NequIP, and ViSNet) and comprehensively evaluated on aspirin, Ac-Ala3-NHMe, and Chignolin MD datasets with the number of atoms ranging from 21 to 166. Driven by the trained MLFFs on these molecules, we performed MD simulations from different initial conformations, analyzed the relationship between the force metrics and the stability of simulation trajectories, and investigated the reason for collapsed simulations. Finally, the performance of MLFFs and the stability of MD simulations can be further improved guided by the proposed force metrics for model training, specifically training MLFF models with these force metrics as loss functions, fine-tuning by reweighting samples in the original dataset, and continued training by recruiting additional unexplored data.
最长约 10秒,即可获得该文献文件

科研通智能强力驱动
Strongly Powered by AbleSci AI
更新
PDF的下载单位、IP信息已删除 (2025-6-4)

科研通是完全免费的文献互助平台,具备全网最快的应助速度,最高的求助完成率。 对每一个文献求助,科研通都将尽心尽力,给求助人一个满意的交代。
实时播报
自由的水绿完成签到,获得积分10
刚刚
番茄酱发布了新的文献求助10
2秒前
cc完成签到 ,获得积分10
2秒前
aoba完成签到 ,获得积分10
3秒前
4秒前
4秒前
李清水完成签到,获得积分10
5秒前
5秒前
6秒前
123发布了新的文献求助10
7秒前
wab完成签到,获得积分0
7秒前
ws发布了新的文献求助30
7秒前
7秒前
搞科研的小李同学完成签到 ,获得积分10
8秒前
讲故事发布了新的文献求助10
8秒前
吴端完成签到,获得积分10
9秒前
Ava应助番茄酱采纳,获得10
11秒前
大模型应助123采纳,获得10
13秒前
优秀谷波完成签到,获得积分10
13秒前
执着的以晴完成签到,获得积分10
14秒前
19秒前
CipherSage应助哈哈哈哈哈哈采纳,获得10
19秒前
21秒前
Lucas应助坚定背包采纳,获得10
22秒前
小蘑菇应助LTT采纳,获得10
24秒前
26秒前
英俊的铭应助ina采纳,获得30
28秒前
狸猫不礼貌完成签到,获得积分10
29秒前
zsp完成签到,获得积分10
30秒前
DanSlobin完成签到,获得积分10
31秒前
优秀谷波发布了新的文献求助10
32秒前
可靠的寒风完成签到,获得积分10
34秒前
50g完成签到,获得积分20
34秒前
35秒前
35秒前
123完成签到,获得积分10
36秒前
38秒前
38秒前
ZJX应助米酒汤圆采纳,获得10
39秒前
灵犀发布了新的文献求助10
39秒前
高分求助中
(应助此贴封号)【重要!!请各用户(尤其是新用户)详细阅读】【科研通的精品贴汇总】 10000
Fermented Coffee Market 2000
PARLOC2001: The update of loss containment data for offshore pipelines 500
A Treatise on the Mathematical Theory of Elasticity 500
Critical Thinking: Tools for Taking Charge of Your Learning and Your Life 4th Edition 500
Phylogenetic study of the order Polydesmida (Myriapoda: Diplopoda) 500
A Manual for the Identification of Plant Seeds and Fruits : Second revised edition 500
热门求助领域 (近24小时)
化学 医学 生物 材料科学 工程类 有机化学 内科学 生物化学 物理 计算机科学 纳米技术 遗传学 基因 复合材料 化学工程 物理化学 病理 催化作用 免疫学 量子力学
热门帖子
关注 科研通微信公众号,转发送积分 5252862
求助须知:如何正确求助?哪些是违规求助? 4416425
关于积分的说明 13749709
捐赠科研通 4288588
什么是DOI,文献DOI怎么找? 2352985
邀请新用户注册赠送积分活动 1349757
关于科研通互助平台的介绍 1309396