Toward the generation of pure coral genomes with experimental and bioinformatic improvements

珊瑚 基因组 生物 进化生物学 计算生物学 生态学 遗传学 基因
作者
Yi‐Si Hu,Wenliang Zhou,Shuyan Sun,Youfang Sun,Wenliang Zhou,Wenliang Zhou,Fuwen Wei
出处
期刊:The Innovation [Elsevier]
卷期号:5 (4): 100643-100643
标识
DOI:10.1016/j.xinn.2024.100643
摘要

Stony corals, the primary architects of coral reef ecosystems, are largely underrepresented in omics studies despite their importance. The presence of endosymbiotic Symbiodiniaceae algae complicates the extraction of pure coral DNA, posing a challenge for genomic research. Here, we devised a comprehensive methodological framework that incorporates various experimental treatments to achieve 99% purity in coral DNA extraction and a robust bioinformatics pipeline to guarantee the assembly of high-quality, contamination-free coral genomes. Validation of our framework using
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