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Genome-wide identification and expression pattern analysis of the GRF transcription factor family in Astragalus mongholicus

转录因子 鉴定(生物学) 生物 遗传学 表达式(计算机科学) 基因组 计算生物学 进化生物学 基因 计算机科学 植物 程序设计语言
作者
Panpan Wang,Zhen Wang,Huiyan Cao,Jiajun He,Qin Chen,Lianqing He,Bo Liu,Jiamei Wang,Lingyang Kong,Weichao Ren,Xiubo Liu,Wei Ma
出处
期刊:Research Square - Research Square
标识
DOI:10.21203/rs.3.rs-3940307/v1
摘要

Abstract Background Astragalus membranaceus is a plant of the Astragalus genus, which is used as a traditional Chinese herbal medicine with extremely high medicinal and edible value.Astragalus mongholics, as one of the representative medicinal materials with the same origin of medicine and food, has a rising market demand for its raw materials, but the quality is different in different production areas. Growth-regulating factors are transcription factors unique to plants that play important roles in plant growth and development. Up to now, there is no report about GRF in A. mongholics. Methods and results This study conducted a genome-wide analysis of the AmGRF gene family, identifying a total of nine AmGRF genes that were classified into subfamily V based on phylogenetic relationships. In the promoter region of the AmGRF gene, we successfully predicted cis-elements that respond to abiotic stress, growth, development, and hormone production in plants. Based on transcriptomic data and real-time quantitative polymerase chain reaction (qPCR) validation, the results showed that AmGRFs were expressed in the roots, stems, and leaves, with overall higher expression in leaves, higher expression ofAmGRF1 and AmGRF8 in roots, and high expression levels of AmGRF1and AmGRF9 in stems. Conclusions The results of this study provide a theoretical basis for the further exploration of the functions of AmGRFsin plant growth and development.
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