亲爱的研友该休息了!由于当前在线用户较少,发布求助请尽量完整的填写文献信息,科研通机器人24小时在线,伴您度过漫漫科研夜!身体可是革命的本钱,早点休息,好梦!

Specific expression network analysis of diabetic nephropathy kidney tissue revealed key methylated sites

小桶 表观遗传学 基因 生物 遗传学 DNA甲基化 发病机制 基因表达 计算生物学 免疫学 转录组
作者
Yanzhe Wang,Wenwei Xu,Dingyu Zhu,Nan Zhang,Yonglan Wang,Miao Ding,Xinmiao Xie,Linlin Sun,Xiaoxia Wang
出处
期刊:Journal of Cellular Physiology [Wiley]
卷期号:233 (10): 7139-7147 被引量:23
标识
DOI:10.1002/jcp.26638
摘要

Diabetic nephropathy (DN) is one of the most common and serious complication in diabetes patients. However, the evidences of gene regulation mechanism and epigenetic modification with DN remain unclear. Therefore, it is necessary to search regulating genes for early diagnosis on DN. We identified tissue specific genes through mining the gene expression omnibus (GEO) public database, enriched function by gene ontology (GO), and kyoto encyclopedia of genes and genomes (KEGG) analysis, and further compared tissue-specific network. Meanwhile, combining with differentially methylated sites, we explored the association epigenetic modification with the pathogenesis of DN. Glomeruli (Glom) may be the main tissue of signal recognition and tubulointerstitium (Tub) is mainly associated with energy metabolism in the occurrence of DN. By comparing tissue-specific networks between Glom and Tub, we screened 319 genes, which played an important role in multiple tissue on kidney. Among them, ANXA2, UBE2L6, MME, IQGAP, SLC7A7, and PLG played a key role in regulating the incidence of DN. Besides, we also identified 1 up-regulated gene (PIK3C2B) and 39 down-regulated genes (POLR2G, DDB1, and ZNF230, etc.) in the methylated data of Glom specific genes. In the Tub specific expressed genes, we identified two hypo-methylated genes (PPARA and GLS). Tub mainly caused abnormal energy metabolism, and Glom caused the changes in cell connections and histone modification. By analyzing differentially methylated sites and tissue-specific expressed genes, we found the change of methylated status about the core regulating genes may be a potential factor in the pathogenesis of DN.
最长约 10秒,即可获得该文献文件

科研通智能强力驱动
Strongly Powered by AbleSci AI
更新
大幅提高文件上传限制,最高150M (2024-4-1)

科研通是完全免费的文献互助平台,具备全网最快的应助速度,最高的求助完成率。 对每一个文献求助,科研通都将尽心尽力,给求助人一个满意的交代。
实时播报
21秒前
Al完成签到 ,获得积分10
27秒前
调皮芫完成签到,获得积分10
29秒前
Wingshuohuo发布了新的文献求助30
29秒前
咸金城发布了新的文献求助10
34秒前
35秒前
mtong发布了新的文献求助10
38秒前
ruann发布了新的文献求助10
44秒前
Wingshuohuo发布了新的文献求助30
54秒前
mtong完成签到 ,获得积分20
55秒前
大个应助咸金城采纳,获得10
58秒前
58秒前
ruann完成签到 ,获得积分10
1分钟前
多C多快乐完成签到 ,获得积分10
1分钟前
1分钟前
tingyeh完成签到,获得积分10
1分钟前
咸金城发布了新的文献求助10
1分钟前
Wingshuohuo发布了新的文献求助30
1分钟前
咸金城发布了新的文献求助10
1分钟前
1分钟前
逆天大脚完成签到,获得积分10
2分钟前
英姑应助兴奋的宛亦采纳,获得30
2分钟前
Wingshuohuo发布了新的文献求助30
2分钟前
烽烽烽发布了新的文献求助10
2分钟前
Wingshuohuo发布了新的文献求助10
2分钟前
Archers完成签到 ,获得积分10
2分钟前
Wingshuohuo发布了新的文献求助30
2分钟前
科研通AI2S应助咸金城采纳,获得10
2分钟前
xz完成签到 ,获得积分10
3分钟前
3分钟前
咸金城发布了新的文献求助10
3分钟前
我是老大应助科研通管家采纳,获得30
3分钟前
CodeCraft应助科研通管家采纳,获得10
3分钟前
Wingshuohuo发布了新的文献求助10
3分钟前
Wingshuohuo发布了新的文献求助30
3分钟前
咸金城发布了新的文献求助10
3分钟前
烟花应助Wingshuohuo采纳,获得10
4分钟前
天天快乐应助咸金城采纳,获得10
4分钟前
4分钟前
咸金城发布了新的文献求助10
4分钟前
高分求助中
Spray / Wall-interaction Modelling by Dimensionless Data Analysis 2000
ALA生合成不全マウスでの糖代謝異常の分子機構解析 520
安全防范技术与工程 500
Mathematics and Finite Element Discretizations of Incompressible Navier—Stokes Flows 500
2024 Medicinal Chemistry Reviews 400
Актуализированная стратиграфическая схема триасовых отложений Прикаспийского региона. Объяснительная записка 360
Dictionary of socialism 350
热门求助领域 (近24小时)
化学 医学 生物 材料科学 工程类 有机化学 生物化学 物理 内科学 纳米技术 计算机科学 化学工程 复合材料 基因 遗传学 催化作用 物理化学 免疫学 量子力学 细胞生物学
热门帖子
关注 科研通微信公众号,转发送积分 3192671
求助须知:如何正确求助?哪些是违规求助? 2841654
关于积分的说明 8034518
捐赠科研通 2505375
什么是DOI,文献DOI怎么找? 1338533
科研通“疑难数据库(出版商)”最低求助积分说明 638361
邀请新用户注册赠送积分活动 606912