亲爱的研友该休息了!由于当前在线用户较少,发布求助请尽量完整的填写文献信息,科研通机器人24小时在线,伴您度过漫漫科研夜!身体可是革命的本钱,早点休息,好梦!

Specific expression network analysis of diabetic nephropathy kidney tissue revealed key methylated sites

小桶 表观遗传学 基因 生物 遗传学 DNA甲基化 发病机制 基因表达 计算生物学 免疫学 转录组
作者
Yanzhe Wang,Wenwei Xu,Dingyu Zhu,Nan Zhang,Yonglan Wang,Miao Ding,Xinmiao Xie,Linlin Sun,Xiaoxia Wang
出处
期刊:Journal of Cellular Physiology [Wiley]
卷期号:233 (10): 7139-7147 被引量:23
标识
DOI:10.1002/jcp.26638
摘要

Diabetic nephropathy (DN) is one of the most common and serious complication in diabetes patients. However, the evidences of gene regulation mechanism and epigenetic modification with DN remain unclear. Therefore, it is necessary to search regulating genes for early diagnosis on DN. We identified tissue specific genes through mining the gene expression omnibus (GEO) public database, enriched function by gene ontology (GO), and kyoto encyclopedia of genes and genomes (KEGG) analysis, and further compared tissue-specific network. Meanwhile, combining with differentially methylated sites, we explored the association epigenetic modification with the pathogenesis of DN. Glomeruli (Glom) may be the main tissue of signal recognition and tubulointerstitium (Tub) is mainly associated with energy metabolism in the occurrence of DN. By comparing tissue-specific networks between Glom and Tub, we screened 319 genes, which played an important role in multiple tissue on kidney. Among them, ANXA2, UBE2L6, MME, IQGAP, SLC7A7, and PLG played a key role in regulating the incidence of DN. Besides, we also identified 1 up-regulated gene (PIK3C2B) and 39 down-regulated genes (POLR2G, DDB1, and ZNF230, etc.) in the methylated data of Glom specific genes. In the Tub specific expressed genes, we identified two hypo-methylated genes (PPARA and GLS). Tub mainly caused abnormal energy metabolism, and Glom caused the changes in cell connections and histone modification. By analyzing differentially methylated sites and tissue-specific expressed genes, we found the change of methylated status about the core regulating genes may be a potential factor in the pathogenesis of DN.
最长约 10秒,即可获得该文献文件

科研通智能强力驱动
Strongly Powered by AbleSci AI
更新
大幅提高文件上传限制,最高150M (2024-4-1)

科研通是完全免费的文献互助平台,具备全网最快的应助速度,最高的求助完成率。 对每一个文献求助,科研通都将尽心尽力,给求助人一个满意的交代。
实时播报
CipherSage应助兴奋的白桃采纳,获得10
1秒前
布鲁爱思完成签到,获得积分10
2秒前
13秒前
DD完成签到 ,获得积分10
13秒前
wave完成签到 ,获得积分10
18秒前
大模型应助shadow采纳,获得10
24秒前
帅婴完成签到,获得积分10
25秒前
35秒前
40秒前
53秒前
星孜发布了新的文献求助10
55秒前
Mingjun完成签到 ,获得积分10
58秒前
三七发布了新的文献求助10
58秒前
59秒前
krajicek完成签到,获得积分10
1分钟前
1分钟前
Rainbow完成签到 ,获得积分10
1分钟前
peanut完成签到 ,获得积分10
1分钟前
活泼新儿完成签到 ,获得积分10
1分钟前
科研通AI2S应助Rita采纳,获得10
1分钟前
1分钟前
JamesPei应助科研通管家采纳,获得20
1分钟前
研友_VZG7GZ应助科研通管家采纳,获得10
1分钟前
CodeCraft应助科研通管家采纳,获得10
1分钟前
酷波er应助俊逸的汲采纳,获得10
1分钟前
1分钟前
1分钟前
1分钟前
刘天宇完成签到 ,获得积分10
1分钟前
欣喜紫真完成签到,获得积分10
1分钟前
俊逸的汲发布了新的文献求助10
1分钟前
holy发布了新的文献求助10
1分钟前
俊逸尔风完成签到 ,获得积分10
1分钟前
善学以致用应助Giraffe采纳,获得10
1分钟前
jyy应助羽化成仙采纳,获得10
1分钟前
feifanyang发布了新的文献求助10
1分钟前
小绵羊完成签到 ,获得积分10
1分钟前
1分钟前
Giraffe完成签到,获得积分10
1分钟前
1分钟前
高分求助中
Spray / Wall-interaction Modelling by Dimensionless Data Analysis 2000
Mixed-anion Compounds 600
A new species of Velataspis (Hemiptera Coccoidea Diaspididae) from tea in Assam 500
Earth System Geophysics 500
Aspects of Babylonian celestial divination: the lunar eclipse tablets of Enūma Anu Enlil 500
Geochemistry, 2nd Edition 地球化学经典教科书第二版 401
2024 Medicinal Chemistry Reviews 400
热门求助领域 (近24小时)
化学 医学 生物 材料科学 工程类 有机化学 生物化学 物理 内科学 纳米技术 计算机科学 化学工程 复合材料 基因 遗传学 催化作用 物理化学 免疫学 量子力学 细胞生物学
热门帖子
关注 科研通微信公众号,转发送积分 3200652
求助须知:如何正确求助?哪些是违规求助? 2850426
关于积分的说明 8072014
捐赠科研通 2514173
什么是DOI,文献DOI怎么找? 1346912
科研通“疑难数据库(出版商)”最低求助积分说明 640281
邀请新用户注册赠送积分活动 610407