Delineation of the intimate details of the backbone conformation of pyridine nucleotide coenzymes in aqueous solution

辅因子 核苷酸 水溶液 吡啶 化学 烟酰胺 侧链 立体化学 结晶学 生物化学 聚合物 有机化学 基因
作者
K. S. Bose,Ramaswamy H. Sarma
出处
期刊:Biochemical and Biophysical Research Communications [Elsevier BV]
卷期号:66 (4): 1173-1179 被引量:87
标识
DOI:10.1016/0006-291x(75)90482-9
摘要

Abstract The noise free 300 MHz 1H NMR spectra of β-DPN+, recorded in the Fourier mode at 12° and 68°C have been completely analysed by extensive computer simulation. It is shown, whether the coenzyme exists as an equilibrium mixture of folded ⇄ extended forms (12°C) or in overwhelminghly extended forms (68°C), the backbone of both the nicotinamide and adenine fragments preferentially exist in 2 E-gg-g′g′ conformation. This orientation is significantly different from those reported in the solid state for the extended species in contact with the enzyme where 2 E-tg-g′g′ and 3 E-tg-g′g′ orientations have been observed. It is suggested that specific interactions of the backbone with the various amino acid residues in the enzyme induces conformational aberrations in the backbone. Intimate details of the backbone conformation of the extended forms of AcPy-DPN+ and β-TPN+ are also presented.
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