Development and Validation of a Prognostic Signature Based on Immune Genes in Cervical Cancer

宫颈癌 肿瘤科 列线图 医学 多元分析 基因签名 免疫系统 内科学 癌症 癌症研究 生物标志物 肿瘤微环境 转录组 比例危险模型 基因表达谱 生存分析 生物 基因 基因表达 免疫学 遗传学
作者
Yu Chen,Hao Lin,Ya-Nan Pi,Chen Xixi,Hu Zhou,Yuan Tian,Weidong Zhao,Bai-Rong Xia
出处
期刊:Frontiers in Oncology [Frontiers Media]
卷期号:11 被引量:5
标识
DOI:10.3389/fonc.2021.616530
摘要

Cervical cancer is one of the most common types of gynecological malignancies worldwide. This study aims to develop an immune signature to predict survival in cervical cancer.The gene expression data of 296 patients with cervical cancer from The Cancer Genome Atlas database (TCGA) and immune-related genes from the Immunology Database and Analysis Portal (ImmPort) database were included in this study. The immune signature was developed based on prognostic genes. The validation dataset was downloaded from the Gene Expression Omnibus (GEO) database.The immune signature namely immune-based prognostic score (IPRS) was developed with 229 genes. Multivariate analysis revealed that the IPRS was an independent prognostic factor for overall survival (OS) and progression-free survival (PFS) in patients with cervical cancer. Patients were stratified into high IPRS and low IPRS groups, and those in the high IPRS group were associated with better survival, which was validated in the validation set. A nomogram with IPRS and stage was constructed to predict mortality in cervical cancer.We developed a robust prognostic signature IPRS that could be used to predict patients' survival outcome.

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