Gene co-expression network analysis identifies BEH3 as a stabilizer of secondary vascular development in Arabidopsis

生物 拟南芥 油菜素甾醇 形成层 转录组 基因 细胞生物学 干细胞 血管组织 基因表达 突变体 维管束 维管形成层 转录因子 基因表达调控 遗传学 植物 木质部
作者
Tomoyuki Furuya,Masato Saito,Haruka Uchimura,Akiko Satake,Shohei Nosaki,Takuya Miyakawa,Shunji Shimadzu,Wataru Yamori,Masaru Tanokura,Hiroo Fukuda,Yuki Kondo
出处
期刊:The Plant Cell [Oxford University Press]
卷期号:33 (8): 2618-2636 被引量:14
标识
DOI:10.1093/plcell/koab151
摘要

In plants, vascular stem cells located in the cambium continuously undergo self-renewal and differentiation during secondary growth. Recent advancements in cell sorting techniques have enabled access to the transcriptional regulatory framework of cambial cells. However, mechanisms underlying the robust control of vascular stem cells remain unclear. Here, we identified a new cambium-related regulatory module through co-expression network analysis using multiple transcriptome datasets obtained from an ectopic vascular cell transdifferentiation system using Arabidopsis cotyledons, Vascular cell Induction culture System Using Arabidopsis Leaves (VISUAL). The cambium gene list included a gene encoding the transcription factor BES1/BZR1 Homolog 3 (BEH3), whose homolog BES1 negatively affects vascular stem cell maintenance. Interestingly, null beh3 mutant alleles showed a large variation in their vascular size, indicating that BEH3 functions as a stabilizer of vascular stem cells. Genetic analysis revealed that BEH3 and BES1 perform opposite functions in the regulation of vascular stem cells and the differentiation of vascular cells in the context of the VISUAL system. At the biochemical level, BEH3 showed weak transcriptional repressor activity and functioned antagonistically to other BES/BZR members by competing for binding to the brassinosteroid response element. Furthermore, mathematical modeling suggested that the competitive relationship between BES/BZR homologs leads to the robust regulation of vascular stem cells.
最长约 10秒,即可获得该文献文件

科研通智能强力驱动
Strongly Powered by AbleSci AI
更新
大幅提高文件上传限制,最高150M (2024-4-1)

科研通是完全免费的文献互助平台,具备全网最快的应助速度,最高的求助完成率。 对每一个文献求助,科研通都将尽心尽力,给求助人一个满意的交代。
实时播报
ricky完成签到,获得积分10
刚刚
搜集达人应助tuyfytjt采纳,获得10
1秒前
1秒前
怡然蜜粉完成签到,获得积分10
2秒前
2秒前
呆萌道消完成签到,获得积分10
2秒前
无花果应助stefanie采纳,获得10
2秒前
木桶人plus完成签到,获得积分10
3秒前
桃花源的瓶起子完成签到,获得积分10
3秒前
冷傲雨寒完成签到,获得积分10
3秒前
ltt完成签到,获得积分20
3秒前
黑祎菲完成签到 ,获得积分10
3秒前
卡卡卡发布了新的文献求助10
4秒前
共享精神应助隐形访冬采纳,获得10
4秒前
完美世界应助活着采纳,获得10
5秒前
5秒前
NPC-CBI完成签到,获得积分10
6秒前
木桶人plus发布了新的文献求助30
6秒前
6秒前
7秒前
香蕉完成签到,获得积分10
7秒前
粗犷的思真完成签到,获得积分10
7秒前
weiye1992发布了新的文献求助10
7秒前
8秒前
8秒前
啦啦啦完成签到,获得积分10
8秒前
Singularity发布了新的文献求助10
8秒前
Jasper应助陈爱佳采纳,获得10
9秒前
9秒前
材1发布了新的文献求助30
10秒前
kk完成签到,获得积分10
10秒前
nnnd77发布了新的文献求助10
10秒前
dandan完成签到,获得积分10
10秒前
一叹发布了新的文献求助10
10秒前
香蕉觅云应助畅快访蕊采纳,获得10
11秒前
12秒前
12秒前
12秒前
啦啦啦发布了新的文献求助10
12秒前
12秒前
高分求助中
Evolution 3rd edition 1500
保险藏宝图 1000
Lire en communiste 1000
Mantiden: Faszinierende Lauerjäger Faszinierende Lauerjäger 700
PraxisRatgeber: Mantiden: Faszinierende Lauerjäger 700
A new species of Coccus (Homoptera: Coccoidea) from Malawi 500
2-Acetyl-1-pyrroline: an important aroma component of cooked rice 500
热门求助领域 (近24小时)
化学 医学 生物 材料科学 工程类 有机化学 生物化学 物理 内科学 纳米技术 计算机科学 化学工程 复合材料 基因 遗传学 催化作用 物理化学 免疫学 量子力学 细胞生物学
热门帖子
关注 科研通微信公众号,转发送积分 3181376
求助须知:如何正确求助?哪些是违规求助? 2831591
关于积分的说明 7985655
捐赠科研通 2493611
什么是DOI,文献DOI怎么找? 1330220
科研通“疑难数据库(出版商)”最低求助积分说明 635954
版权声明 602955