Gene co-expression network analysis identifies BEH3 as a stabilizer of secondary vascular development in Arabidopsis

生物 拟南芥 油菜素甾醇 形成层 转录组 基因 细胞生物学 干细胞 血管组织 基因表达 突变体 维管束 维管形成层 转录因子 基因表达调控 遗传学 植物 木质部
作者
Tomoyuki Furuya,Masato Saito,Haruka Uchimura,Akiko Satake,Shohei Nosaki,Takuya Miyakawa,Shunji Shimadzu,Wataru Yamori,Masaru Tanokura,Hiroo Fukuda,Yuki Kondo
出处
期刊:The Plant Cell [Oxford University Press]
卷期号:33 (8): 2618-2636 被引量:14
标识
DOI:10.1093/plcell/koab151
摘要

In plants, vascular stem cells located in the cambium continuously undergo self-renewal and differentiation during secondary growth. Recent advancements in cell sorting techniques have enabled access to the transcriptional regulatory framework of cambial cells. However, mechanisms underlying the robust control of vascular stem cells remain unclear. Here, we identified a new cambium-related regulatory module through co-expression network analysis using multiple transcriptome datasets obtained from an ectopic vascular cell transdifferentiation system using Arabidopsis cotyledons, Vascular cell Induction culture System Using Arabidopsis Leaves (VISUAL). The cambium gene list included a gene encoding the transcription factor BES1/BZR1 Homolog 3 (BEH3), whose homolog BES1 negatively affects vascular stem cell maintenance. Interestingly, null beh3 mutant alleles showed a large variation in their vascular size, indicating that BEH3 functions as a stabilizer of vascular stem cells. Genetic analysis revealed that BEH3 and BES1 perform opposite functions in the regulation of vascular stem cells and the differentiation of vascular cells in the context of the VISUAL system. At the biochemical level, BEH3 showed weak transcriptional repressor activity and functioned antagonistically to other BES/BZR members by competing for binding to the brassinosteroid response element. Furthermore, mathematical modeling suggested that the competitive relationship between BES/BZR homologs leads to the robust regulation of vascular stem cells.
最长约 10秒,即可获得该文献文件

科研通智能强力驱动
Strongly Powered by AbleSci AI
更新
大幅提高文件上传限制,最高150M (2024-4-1)

科研通是完全免费的文献互助平台,具备全网最快的应助速度,最高的求助完成率。 对每一个文献求助,科研通都将尽心尽力,给求助人一个满意的交代。
实时播报
1秒前
11发布了新的文献求助10
2秒前
辛勤夜安完成签到 ,获得积分10
2秒前
大个应助zy采纳,获得10
2秒前
Sophia发布了新的文献求助10
3秒前
科研通AI2S应助留你在此处采纳,获得10
3秒前
谦让钧发布了新的文献求助10
4秒前
7秒前
8秒前
梅思寒发布了新的文献求助30
8秒前
9秒前
老迟到的树叶关注了科研通微信公众号
10秒前
Akim应助跳跃的兰采纳,获得10
10秒前
Jiling完成签到,获得积分10
11秒前
段祥发布了新的文献求助10
12秒前
大个应助11采纳,获得10
15秒前
丘比特应助无情的世倌采纳,获得10
17秒前
8R60d8应助稳稳采纳,获得10
17秒前
17秒前
丽丽完成签到,获得积分10
19秒前
河边看水发布了新的文献求助10
21秒前
22秒前
22秒前
任性的冷梅完成签到,获得积分10
22秒前
carrie完成签到 ,获得积分10
23秒前
23秒前
科研通AI2S应助hjkl采纳,获得10
23秒前
maomao1986完成签到,获得积分10
24秒前
聘聘发布了新的文献求助30
25秒前
lsq108发布了新的文献求助10
27秒前
零加完成签到,获得积分10
28秒前
29秒前
LSY完成签到,获得积分10
29秒前
29秒前
29秒前
29秒前
科研通AI2S应助迈克老狼采纳,获得10
30秒前
巫马忆翠发布了新的文献求助10
30秒前
32秒前
32秒前
高分求助中
Spray / Wall-interaction Modelling by Dimensionless Data Analysis 2000
Evolution 3rd edition 1500
保险藏宝图 1000
Lire en communiste 1000
Mantiden: Faszinierende Lauerjäger Faszinierende Lauerjäger 700
PraxisRatgeber: Mantiden: Faszinierende Lauerjäger 700
Mathematics and Finite Element Discretizations of Incompressible Navier—Stokes Flows 500
热门求助领域 (近24小时)
化学 医学 生物 材料科学 工程类 有机化学 生物化学 物理 内科学 纳米技术 计算机科学 化学工程 复合材料 基因 遗传学 催化作用 物理化学 免疫学 量子力学 细胞生物学
热门帖子
关注 科研通微信公众号,转发送积分 3186182
求助须知:如何正确求助?哪些是违规求助? 2836515
关于积分的说明 8009537
捐赠科研通 2498848
什么是DOI,文献DOI怎么找? 1333962
科研通“疑难数据库(出版商)”最低求助积分说明 636964
邀请新用户注册赠送积分活动 604863