Gene co-expression network analysis identifies BEH3 as a stabilizer of secondary vascular development in Arabidopsis

生物 拟南芥 油菜素甾醇 形成层 转录组 基因 细胞生物学 干细胞 血管组织 基因表达 突变体 维管束 维管形成层 转录因子 基因表达调控 遗传学 植物 木质部
作者
Tomoyuki Furuya,Masato Saito,Haruka Uchimura,Akiko Satake,Shohei Nosaki,Takuya Miyakawa,Shunji Shimadzu,Wataru Yamori,Masaru Tanokura,Hiroo Fukuda,Yuki Kondo
出处
期刊:The Plant Cell [Oxford University Press]
卷期号:33 (8): 2618-2636 被引量:14
标识
DOI:10.1093/plcell/koab151
摘要

In plants, vascular stem cells located in the cambium continuously undergo self-renewal and differentiation during secondary growth. Recent advancements in cell sorting techniques have enabled access to the transcriptional regulatory framework of cambial cells. However, mechanisms underlying the robust control of vascular stem cells remain unclear. Here, we identified a new cambium-related regulatory module through co-expression network analysis using multiple transcriptome datasets obtained from an ectopic vascular cell transdifferentiation system using Arabidopsis cotyledons, Vascular cell Induction culture System Using Arabidopsis Leaves (VISUAL). The cambium gene list included a gene encoding the transcription factor BES1/BZR1 Homolog 3 (BEH3), whose homolog BES1 negatively affects vascular stem cell maintenance. Interestingly, null beh3 mutant alleles showed a large variation in their vascular size, indicating that BEH3 functions as a stabilizer of vascular stem cells. Genetic analysis revealed that BEH3 and BES1 perform opposite functions in the regulation of vascular stem cells and the differentiation of vascular cells in the context of the VISUAL system. At the biochemical level, BEH3 showed weak transcriptional repressor activity and functioned antagonistically to other BES/BZR members by competing for binding to the brassinosteroid response element. Furthermore, mathematical modeling suggested that the competitive relationship between BES/BZR homologs leads to the robust regulation of vascular stem cells.
最长约 10秒,即可获得该文献文件

科研通智能强力驱动
Strongly Powered by AbleSci AI
更新
大幅提高文件上传限制,最高150M (2024-4-1)

科研通是完全免费的文献互助平台,具备全网最快的应助速度,最高的求助完成率。 对每一个文献求助,科研通都将尽心尽力,给求助人一个满意的交代。
实时播报
1秒前
吃吃发布了新的文献求助30
3秒前
antonioli完成签到,获得积分10
4秒前
耶耶完成签到,获得积分10
4秒前
聪明碧玉完成签到,获得积分20
5秒前
6秒前
和平使命应助叮咚采纳,获得20
7秒前
8秒前
希望天下0贩的0应助shihui采纳,获得10
8秒前
9秒前
王也发布了新的文献求助30
11秒前
yue发布了新的文献求助10
11秒前
momo发布了新的文献求助10
13秒前
14秒前
爆米花应助宇文宛菡采纳,获得10
16秒前
16秒前
情怀应助nannan采纳,获得10
16秒前
yue完成签到,获得积分10
17秒前
星辰大海应助科研小白采纳,获得10
18秒前
梨llll发布了新的文献求助10
19秒前
Wyu应助Jude采纳,获得10
19秒前
珊熙发布了新的文献求助10
19秒前
爱猫的纭发布了新的文献求助10
20秒前
桐桐应助盛夏之末采纳,获得10
21秒前
跳跃的岂愈完成签到,获得积分10
22秒前
amber发布了新的文献求助10
22秒前
柒z完成签到,获得积分10
25秒前
聪明碧玉发布了新的文献求助30
25秒前
田様应助mt采纳,获得10
25秒前
完美世界应助吃吃采纳,获得10
26秒前
科研通AI2S应助sigarc采纳,获得10
27秒前
27秒前
29秒前
29秒前
29秒前
传奇3应助caolixin采纳,获得10
30秒前
科研通AI2S应助峰宝宝采纳,获得10
31秒前
余姓懒完成签到,获得积分10
32秒前
zho发布了新的文献求助10
32秒前
凉水完成签到,获得积分10
32秒前
高分求助中
Spray / Wall-interaction Modelling by Dimensionless Data Analysis 2000
Evolution 3rd edition 1500
保险藏宝图 1000
Lire en communiste 1000
Mantiden: Faszinierende Lauerjäger Faszinierende Lauerjäger 700
PraxisRatgeber: Mantiden: Faszinierende Lauerjäger 700
Mathematics and Finite Element Discretizations of Incompressible Navier—Stokes Flows 500
热门求助领域 (近24小时)
化学 医学 生物 材料科学 工程类 有机化学 生物化学 物理 内科学 纳米技术 计算机科学 化学工程 复合材料 基因 遗传学 催化作用 物理化学 免疫学 量子力学 细胞生物学
热门帖子
关注 科研通微信公众号,转发送积分 3186310
求助须知:如何正确求助?哪些是违规求助? 2836572
关于积分的说明 8010078
捐赠科研通 2498950
什么是DOI,文献DOI怎么找? 1334016
科研通“疑难数据库(出版商)”最低求助积分说明 636981
邀请新用户注册赠送积分活动 604890