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Simultaneous BRAFV600E Protein and DNA Aberration Detection in Circulating Melanoma Cells Using an Integrated Multimolecular Sensor

液体活检 黑色素瘤 生物标志物 溶解 DNA 活检 癌症研究 细胞 癌症 化学 计算生物学 病理 医学 生物 分子生物学 内科学 生物化学
作者
Alain Wuethrich,Shuvashis Dey,Kevin M. Koo,Abu Ali Ibn Sina,Matt Trau
出处
期刊:Methods in molecular biology 卷期号:: 265-276
标识
DOI:10.1007/978-1-0716-1205-7_20
摘要

Liquid biopsy has emerged as the next generation target for diagnostics and therapeutic monitoring of many diseases including cancer. Liquid biopsy offers noninvasive analysis of aberrant biomolecular changes (e.g., aberrant protein expression, DNA mutation) which can provide crucial information on disease stages and therapy responses. As a diagnostically important biomarker for melanoma, the detection of the BRAFV600E aberration at the DNA and protein level in liquid biopsies confers an attractive option. This method describes the preparation and operation of an integrated multimolecular sensor (IMMS) for simultaneous detection of the BRAFV600E aberration in both molecular forms from circulating melanoma cells in liquid biopsy. IMMS integrates specific melanoma cell capture, cell release, cell lysis, and electrochemical BRAFV600E detection on a single device. IMMS is demonstrated for a sample-to-answer workflow of plasma spiked with melanoma cells.
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