A diagnostic model based on gene biomarkers for Crohn’s disease

接收机工作特性 Lasso(编程语言) 列线图 逻辑回归 计算生物学 疾病 基因 曲线下面积 医学 生物 生物信息学 计算机科学 遗传学 肿瘤科 内科学 万维网 药代动力学
作者
Shasha Wu,Lin Zeng,Jisheng Wang
出处
期刊:General Physiology and Biophysics [AEPress]
卷期号:42 (04): 339-347 被引量:2
标识
DOI:10.4149/gpb_2023012
摘要

Crohn's disease (CD) is a segmental chronic inflammatory bowel disease, which seriously affects the patient's quality of life.The etiology of CD is not yet clear, and there is still a lack of effective treatments.Therefore, in this study, we focus on developing a useful model for early diagnosis and targeted therapy of CD.The expression datasets of CD were collected to filter differentially expressed genes (DEGs) by overlapping "limma" package and "WGCNA" package.Then, functional enrichment analysis and protein-protein interaction (PPI) network analyses were performed.Hub genes were screened with "cytoHubba" plug-in and filtered with LASSO and stepwise regression analyses.The logistic regression model and nomogram were established based on the selected hub genes.The 45 DEGs were identified and the top 30 hub genes were chosen out for further study.Finally, 11 genes were selected to construct the logistic regression model and nomogram.The receiver operating characteristic (ROC) curve shows that the area under the curve (AUC) value was 0.960 in the training dataset and 0.760 in the validation dataset.A 11-gene diagnostic model was constructed with IL1B, CXCL10, CXCL2, LCN2, MMP12, CXCL9, NOS2, GBP5, FPR1, GBP4 and WARS, which may become potential biomarkers for early diagnosis and targeted therapy of CD.
最长约 10秒,即可获得该文献文件

科研通智能强力驱动
Strongly Powered by AbleSci AI
更新
PDF的下载单位、IP信息已删除 (2025-6-4)

科研通是完全免费的文献互助平台,具备全网最快的应助速度,最高的求助完成率。 对每一个文献求助,科研通都将尽心尽力,给求助人一个满意的交代。
实时播报
感动的念双完成签到,获得积分10
刚刚
酷波er应助chenkaixin采纳,获得10
1秒前
vanilla完成签到,获得积分10
1秒前
小青蛙OA完成签到,获得积分10
2秒前
蓁蓁发布了新的文献求助10
2秒前
Orange应助hao采纳,获得10
2秒前
量子星尘发布了新的文献求助10
2秒前
cyndi完成签到,获得积分0
5秒前
6秒前
贰鸟应助七月流火采纳,获得10
7秒前
yulia完成签到 ,获得积分10
8秒前
佳期如梦完成签到 ,获得积分10
8秒前
9秒前
阿Q完成签到,获得积分10
10秒前
11秒前
彬琪发布了新的文献求助10
12秒前
12秒前
13秒前
13秒前
雨木目完成签到,获得积分10
14秒前
小鱼完成签到,获得积分10
14秒前
chenkaixin发布了新的文献求助10
14秒前
梦XING完成签到 ,获得积分10
15秒前
eternity136发布了新的文献求助10
15秒前
vv完成签到,获得积分10
16秒前
16秒前
哈哈哈哈发布了新的文献求助20
16秒前
KANG完成签到,获得积分10
17秒前
义气黄焖排骨完成签到,获得积分10
17秒前
18秒前
如梦如画发布了新的文献求助10
18秒前
Hannes应助15902933324sjc采纳,获得10
19秒前
19秒前
19秒前
梓默完成签到 ,获得积分10
19秒前
我是老大应助Japan采纳,获得10
20秒前
彬琪完成签到,获得积分10
20秒前
红尘踏歌完成签到,获得积分10
20秒前
不忘初心发布了新的文献求助10
21秒前
18746005898完成签到 ,获得积分10
21秒前
高分求助中
【提示信息,请勿应助】关于scihub 10000
Les Mantodea de Guyane: Insecta, Polyneoptera [The Mantids of French Guiana] 3000
徐淮辽南地区新元古代叠层石及生物地层 3000
The Mother of All Tableaux: Order, Equivalence, and Geometry in the Large-scale Structure of Optimality Theory 3000
Global Eyelash Assessment scale (GEA) 1000
Picture Books with Same-sex Parented Families: Unintentional Censorship 550
Research on Disturbance Rejection Control Algorithm for Aerial Operation Robots 500
热门求助领域 (近24小时)
化学 材料科学 医学 生物 工程类 有机化学 生物化学 物理 内科学 纳米技术 计算机科学 化学工程 复合材料 遗传学 基因 物理化学 催化作用 冶金 细胞生物学 免疫学
热门帖子
关注 科研通微信公众号,转发送积分 4038619
求助须知:如何正确求助?哪些是违规求助? 3576294
关于积分的说明 11375058
捐赠科研通 3306084
什么是DOI,文献DOI怎么找? 1819374
邀请新用户注册赠送积分活动 892698
科研通“疑难数据库(出版商)”最低求助积分说明 815066