Mapping the topography of spatial gene expression with interpretable deep learning

深度学习 人工智能 表达式(计算机科学) 计算生物学 基因表达 空间学习 地质学 地图学 模式识别(心理学) 基因 计算机科学 地理 生物 神经科学 遗传学 程序设计语言 海马体
作者
Uthsav Chitra,Brian J. Arnold,Hirak Sarkar,Cong Ma,Sereno Lopez-Darwin,Kohei Sanno,Benjamin J. Raphael
标识
DOI:10.1101/2023.10.10.561757
摘要

Spatially resolved transcriptomics technologies provide high-throughput measurements of gene expression in a tissue slice, but the sparsity of this data complicates the analysis of spatial gene expression patterns such as gene expression gradients. We address these issues by deriving a
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