Analysis of potential biomarkers and immune infiltration in autism based on bioinformatics analysis

免疫系统 自闭症谱系障碍 自闭症 医学 微阵列分析技术 微阵列 基因 基因芯片分析 病因学 发病机制 计算生物学 CD8型 生物信息学 免疫学 基因表达 遗传学 生物 病理 精神科
作者
Wenjun Cao,Chenghan Luo,Zhaohan Fan,Mengyuan Lei,Xinru Cheng,Zanyang Shi,Fengxia Mao,Qian-Ya Xu,Zhaoqin Fu,Qian Zhang
出处
期刊:Medicine [Ovid Technologies (Wolters Kluwer)]
卷期号:102 (19): e33340-e33340 被引量:3
标识
DOI:10.1097/md.0000000000033340
摘要

Autism spectrum disorder (ASD) is a complex neurodevelopmental disorder caused by both environmental and genetic factors. However, its etiology and pathogenesis remain unclear. The purpose of this study was to establish an immune-related diagnostic model for ASD using bioinformatics methods and to identify ASD biomarkers. Two ASD datasets, GSE18123 and GSE29691, were integrated into the gene expression Database to eliminate batch effects. 41 differentially expressed genes were identified by microarray data linear model (limma package). Based on the results of the immune infiltration analysis, we speculated that neutrophils, B cells naive, CD8+ T cells, and Tregs are potential core immune cells in ASD and participate in the occurrence of ASD. Finally, the differential genes and immune infiltration in ASD and non-ASD patients were compared, and the most relevant genes were selected to construct the first immune correlation prediction model of ASD. After the calculation, the model exhibited better accuracy. The calculations show that the model has good accuracy.
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